>literature.s.mediterranea1
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
xxxxxxx<<<<<<<<xxxxxxxxx<<<<<<<<xxx>>>>>>>>xxx>>>>>>>>xx<<<<<xxxx>>>>>xxxxxxxxxxxx<<<<<<<<<xxxxx>>>>>>>>>xx
.......((((((((.........((((((((...))))))))...))))))))..(((((....)))))............(((((((((.....))))))))).. -43.84
>final.s.mediterranea1.22C
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
........................<.................>>>...............................................................
...(((((((((((....((....((((((((...))))))))..)))))))))..(((((....)))))........))))(((((((((.....))))))))).. -48.31
>final.s.mediterranea1.22C.SMconstraint
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
........................<................>>>.............................xxxxxxx<<<<<<<<<<<<>>>>>>>>>>>>>>>
.......(((((((....((....((((((((...))))))))..)))))))))..(((((....)))))............(((((((((.....))))))))).. -43.87

>s.mediterranea1.mini0
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
...(((((((((((((((((....).((((((...)))))))))).))))))))..(((((....)))))........))))(((((((((.....))))))))).. -48.58
>s.mediterranea1.mini1
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
.<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<................>>>(((...)))...(((((....)))))...xxxxxxx<<<<<<<<<<<<<<>>>>>>>>>>>>. 
(((((..((.(((.((((..........)))))))))..)))))(((...)))((.(((((....))))).)).........(((((((((.....))))))))).. -32.07 *
>s.mediterranea1.mini2
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
.......................<<................>>>.............................xxxxxxx<<<<<<<<<<<<<<>>>>>>>>>>>>. 
.......(((((((....((....((((((((...))))))))..)))))))))..(((((....)))))............(((((((((.....))))))))).. -43.87
>s.mediterranea1.mini3
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
.......................<<................>>>.>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>.xxxxxxx<<<<<<<<<<<<<<>>>>>>>>>>>>. 
...(((.(((((((....((....((((((((...))))))))..)))))))))....))).....................(((((((((.....))))))))).. -37.88
>s.mediterranea1.mini4
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
.......................<<................>>>.>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>.xxxxxxx<xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx. 
...(((.(((((((....((....((((((((...))))))))..)))))))))....))).............................................. -21.96
>s.mediterranea1.mini5
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
..<<<<<<<<<<<<<<<<<<<..<<................>>>(((...)))<<<<((((<<<<))))(((<<<<>>>)))>>xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx. 
(((((..((.(((.((((..........)))))))))..)))))(((...)))....((((....))))(((((...)))))......................... -15.99
>s.mediterranea1.mini6
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
..<<<<<<<<<<<<<<<<<<<..<<................>>>>>>......................(((<<<<>>>)))>>........xxxxxxxxxxxxxx. 
.......(((((((....((....((((((((...))))))))..)))))))))...((((....))))(((((...)))))......................... -28.24
>s.mediterranea1.mini7
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
..<<<<<<<<<<<<<<<<<<<..<<................>>>>>>.................<<<<<(((<<<<>>>)))>>>>>>>>>>>>>>>>>>xxxx>>> 
...(((.(((((((....((....((((((((...))))))))..)))))))))....))).(((((..(((((...)))))....))).))............... -26.57
>s.mediterranea1.mini8
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<.<<................>>>(((...)))................(((<<<<>>>))).<<<<<<<<<<<>>>>>>>>>>>.. 
(((((..((.(((.((((..........)))))))))..)))))(((...)))....((((....))))(((((...)))))(((((((((.....))))))))).. -31.91
>s.mediterranea1.mini9
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
.......................<<................>>>.........................(((<<<<>>>))).<<<<<<<<<<<>>>>>>>>>>>.. 
.......(((((((....((....((((((((...))))))))..)))))))))...((((....))))(((((...)))))(((((((((.....))))))))).. -44.16 *
>s.mediterranea1.mini10
GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
.......................<<................>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>....(((<<<<>>>)))....<<<<<<<<>>>>>>>>>>>.. 
...(((.(((((((....((....((((((((...))))))))..)))))))))....)))........(((((...)))))(((((((((.....))))))))).. -41.19 *





s.mediterranea1            GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAATCTTATATGGTACGGACCGTTATCCAACATTAGTTGGTTAATTTTTGACAGTCACTTGAATCACAAGTGACTAT
s.mediterranea2            GCCGTTAGACGGTCTTATCGAAATCTATATAAAAATTATATGGTGAGGACCGTTTGCCAGCATTAGTTGGCTAATTTTTGACAGTAGCTTGCAT.GCAAGTGACTAT
#=GG SS_cons zayas05       .......<<<<<<<<.........<<<<<<<<...>>>>>>>>...>>>>>>>>..<<<<<....>>>>>............<<<<<<<<<.....>>>>>>>>>..
#=GC SS_cons               ..........................................|.............................xxxxxxxxx..........................