>literature.h.contortus.2
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
xxxxxxxx<<<<<<<<<xxxx>>>>>>xx>>>xxxx<<<<xxx<<<xxxx>>>xxxx>>>>xxxxxxxxxxxxxxxxxxxx<<<<<<<<<<<xxx>>>>>>>>>>>xxxxxxx
........(((((((((....))))))..)))....((((...(((....)))....))))....................((((.(((((.....))))).))))....... -37.63
>final.h.contortus.2.25C
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
.....................>>>.........................................................................................
((((....(((((((((....))))))..))).....)))).((((.(((.((((........)))).)))....))))..((((.(((((.....))))).))))....... -47.38
>final.h.contortus.2.25C.SMconstraint
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
.....................>>>..............................................xxxxxxx....................................
((((....(((((((((....))))))..))).....)))).....(((((((((........))))..............((((.(((((.....))))).)))).))))). -45.82

>h.contortus.2.mini0
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
((((....(((((((((....))))))..))).....)))).((((.(((.((((........)))).)))....))))..((((.(((((.....))))).))))....... -47.38
>h.contortus.2.mini1
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
xxxx.....<<<<<<<<....>>>>>>>...<<<<<<<>>>>>>>>>><<<<<<<>>>>>>>>>>>....xxxxxxx.<<<<<<<<<<<<<<<>>>>>>>>>>>>>.xxxxx.
...........((((((....))))))..(((.(......).)))...((.((((........)))).))...........((((.(((((.....))))).))))....... -33.91
>h.contortus.2.mini2
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
xxxx.................>>>..............................................xxxxxxx.<<<<<<<<<<<<<<<>>>>>>>>>>>>>.xxxxx.
...........((((((....))))))..(((.((.(((((..(((....)))..).))))...)))))............((((.(((((.....))))).))))....... -39.91
>h.contortus.2.mini3
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
.....................>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>.xxxxxxx.<<<<<<<<<<<<<<<>>>>>>>>>>>>>.xxxxx.
((((....(((((((((....))))))..))).....))))........................................((((.(((((.....))))).))))....... -35.12
>h.contortus.2.mini4
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
.....................>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>.xxxxxxx.xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx.xxxxx.
((((....(((((((((....))))))..))).....))))........................................................................ -17.74
>h.contortus.2.mini5
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
xxx..................>>>.....<<<<..>>>>>>><(((<<>>)))>>>..<<<<<<<<<......>>>>>>>>xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
...........((((((....))))))..((........))..(((....)))....(((.((((........)))))))................................. -17.52
>h.contortus.2.mini6
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
xxx.xxxxxx...........>>>......<<<<<<<<<<<<>>>>>>>>>>>>>>..<<<<<<<<<......>>>>>>>>xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
...........((((((....))))))....((....((((..........))))))(((.((((........)))))))................................. -17.81
>h.contortus.2.mini7
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
xxx..................>>>.................................<<<<<<<<<<......>>>>>>>>>>>.>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
........(((((((((....))))))..))).(((((.((((((.((.(((...(((((.((((........))))))).)).)))..)))))....))))))))....... -41.15
>h.contortus.2.mini8
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
xxx..................>>>.....(((<....>>))).(((....)))....<<<<<<<<<<......>>>>>>>>....<<((((<<<<>))))>>>>>>>>>xxxx
...........((((((....))))))..((((....).))).(((....)))....(((.((((........))))))).((((.(((((.....))))).))))....... -34.69
>h.contortus.2.mini9
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
xxx..................>>>.................................<<<<<<<<<<......>>>>>>>>....<<((((<<<<>))))>>>>>>>>>xxxx
........(((((((((....))))))..))).((..((((..........))))))(((.((((........))))))).((((.(((((.....))))).))))....... -39.26
>h.contortus.2.mini10
GGTTTTAACCCAGTATCTCAAGGTACTACGGGCGTCTGACCTTCCACTTGTGGTTGCGTCACAAACCTCAATTTTTGGATAGCTCACTCGGGGAATCCGGGCGGGCAACAAGC
.....................>>>.........................<<<<<<<<<<<<<<<<<<......>>>>>>>>....<<((((<<<<>))))>>>>>>xxxxxxx
((((....(((((((((....))))))..))).....)))).((((.....(((((............)))))..))))..((((.(((((.....))))).))))....... -40.79