#Overview on processed synteny regions for C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info # AlnScore QueryFile TargetGenome chr/contig chr startPos endPos hitsCount queryCov meanIdentity ori score compara ############## # Danio_rerio.glob04.21.minQN1.fac2.02.blastresult 2550 2550 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 21 ############## # Danio_rerio.glob05.14.minQN1.fac2.01.blastresult 1796 1796 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 14 ############## # Danio_rerio.glob47.Zv7_NA3207.minQN1.fac2.01.blastresult 670 670 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio Zv7_NA3207 ############## # Danio_rerio.glob06.21.minQN1.fac2.03.blastresult 1107 1107 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 21 21 43615612 43626244 2 81.1% 46.1% 1 172 ortholog_one2one:ENSDARG00000058999_(ENSDARP00000076430) ##For comparison: OptHitEntry for p13=>ENSP00000231656=>CDX1_HUMAN maxScore=172(q2) ############## # Danio_rerio.glob03.21.minQN1.fac2.01.blastresult 1183 1183 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 21 ############## # Danio_rerio.glob07.14.minQN1.fac2.02.blastresult 1514 1514 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 14 ############## # Danio_rerio.glob09.1.minQN1.fac2.01.blastresult 991 991 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 1 ############## # Danio_rerio.glob40.20.minQN1.fac2.04.blastresult 361 361 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 20 ############## # Danio_rerio.glob08.12.minQN1.fac2.01.blastresult 1173 1173 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 12 ############## # Danio_rerio.glob38.6.minQN1.fac2.03.blastresult 108 108 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 6 ############## # Danio_rerio.glob58.14.minQN1.fac2.04.blastresult 846 846 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 14 14 25691140 25714598 3 84.9% 45.8% -1 163 NOMATCH:ENSDARG00000071571(ENSDARP00000096679 [cdx1a]); ##For comparison: OptHitEntry for p13=>ENSP00000231656=>CDX1_HUMAN maxScore=163(q2) ############## # Danio_rerio.glob50.12.minQN1.fac2.03.blastresult 472 472 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 12 ############## # Danio_rerio.glob53.24.minQN1.fac2.02.blastresult 439 439 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 24 ############## # Danio_rerio.glob01.13.minQN1.fac2.01.blastresult 2006 2006 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 13 ############## # Danio_rerio.glob51.16.minQN1.fac2.03.blastresult 589 589 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 16 16 15953566 15954702 2 58.9% 37.6% -1 105.1 NOMATCH:ENSDARG00000023031(ENSDARP00000023072 [hoxa2b]); ##For comparison: OptHitEntry for p13=>ENSP00000231656=>CDX1_HUMAN maxScore=105.1(q1) ############## # Danio_rerio.glob43.9.minQN1.fac2.01.blastresult 236 236 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 9 ############## # Danio_rerio.glob35.6.minQN1.fac2.02.blastresult 935 935 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 6 ############## # Danio_rerio.glob27.5.minQN1.fac2.01.blastresult 1349 1349 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 5 ############## # Danio_rerio.glob54.16.minQN1.fac2.04.blastresult 179 179 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 16 ############## # Danio_rerio.glob52.1.minQN1.fac2.02.blastresult 352 352 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 1 ############## # Danio_rerio.glob13.12.minQN1.fac2.02.blastresult 583 583 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 12 ############## # Danio_rerio.glob12.7.minQN1.fac2.02.blastresult 815 815 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 7 ############## # Danio_rerio.glob33.18.minQN1.fac2.01.blastresult 331 331 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 18 ############## # Danio_rerio.glob28.5.minQN1.fac2.02.blastresult 254 254 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 5 ############## # Danio_rerio.glob32.8.minQN1.fac2.01.blastresult 606 606 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 8 ############## # Danio_rerio.glob36.2.minQN1.fac2.04.blastresult 617 617 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 2 ############## # Danio_rerio.glob48.4.minQN1.fac2.03.blastresult 478 478 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 4 ############## # Danio_rerio.glob49.Zv7_NA1102.minQN1.fac2.01.blastresult 473 473 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio Zv7_NA1102 ############## # Danio_rerio.glob25.23.minQN1.fac2.01.blastresult 264 264 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 23 ############## # Danio_rerio.glob46.13.minQN1.fac2.04.blastresult 401 401 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 13 ############## # Danio_rerio.glob57.7.minQN1.fac2.03.blastresult 407 407 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 7 ############## # Danio_rerio.glob59.4.minQN1.fac2.04.blastresult 435 435 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 4 ############## # Danio_rerio.glob60.1.minQN1.fac2.03.blastresult 432 432 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 1 ############## # Danio_rerio.glob18.2.minQN1.fac2.01.blastresult 916 916 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 2 ############## # Danio_rerio.glob11.16.minQN1.fac2.01.blastresult 605 605 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 16 ############## # Danio_rerio.glob21.4.minQN1.fac2.01.blastresult 664 664 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 4 ############## # Danio_rerio.glob16.20.minQN1.fac2.02.blastresult 940 940 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 20 ############## # Danio_rerio.glob23.2.minQN1.fac2.03.blastresult 530 530 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 2 ############## # Danio_rerio.glob24.22.minQN1.fac2.01.blastresult 464 464 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 22 ############## # Danio_rerio.glob29.15.minQN1.fac2.02.blastresult 444 444 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 15 ############## # Danio_rerio.glob44.14.minQN1.fac2.03.blastresult 953 953 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 14 14 37387109 37389654 3 93.2% 48.1% -1 215.1 between_species_paralog:ENSDARG00000036292_(ENSDARP00000052708 [cdx4]) ##For comparison: OptHitEntry for p13=>ENSP00000231656=>CDX1_HUMAN maxScore=215.1(q2) ############## # Danio_rerio.glob02.7.minQN1.fac2.01.blastresult 2238 2238 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 7 ############## # Danio_rerio.glob55.17.minQN1.fac2.02.blastresult 281 281 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 17 ############## # Danio_rerio.glob56.11.minQN1.fac2.01.blastresult 498 498 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 11 ############## # Danio_rerio.glob19.2.minQN1.fac2.02.blastresult 571 571 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 2 ############## # Danio_rerio.glob42.8.minQN1.fac2.02.blastresult 726 726 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 8 ############## # Danio_rerio.glob14.10.minQN1.fac2.01.blastresult 328 328 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 10 ############## # Danio_rerio.glob45.13.minQN1.fac2.03.blastresult 339 339 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 13 ############## # Danio_rerio.glob10.13.minQN1.fac2.02.blastresult 383 383 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 13 ############## # Danio_rerio.glob34.4.minQN1.fac2.02.blastresult 702 702 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 4 ############## # Danio_rerio.glob15.20.minQN1.fac2.01.blastresult 781 781 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 20 ############## # Danio_rerio.glob20.25.minQN1.fac2.01.blastresult 628 628 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 25 ############## # Danio_rerio.glob17.15.minQN1.fac2.01.blastresult 1072 1072 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 15 ############## # Danio_rerio.glob37.16.minQN1.fac2.02.blastresult 514 514 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 16 ############## # Danio_rerio.glob22.6.minQN1.fac2.01.blastresult 559 559 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 6 ############## # Danio_rerio.glob30.24.minQN1.fac2.01.blastresult 336 336 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 24 ############## # Danio_rerio.glob39.2.minQN1.fac2.05.blastresult 378 378 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 2 ############## # Danio_rerio.glob41.17.minQN1.fac2.01.blastresult 342 342 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 17 ############## # Danio_rerio.glob31.22.minQN1.fac2.02.blastresult 541 541 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 22 ############## # Danio_rerio.glob26.20.minQN1.fac2.03.blastresult 517 517 C4_CDX1_ENSG00000113722_1e6.protein.info Danio_rerio 20