#Overview on processed synteny regions for C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info # AlnScore QueryFile TargetGenome chr/contig chr startPos endPos hitsCount queryCov meanIdentity ori score compara ############## # Danio_rerio.glob37.10.minQN1.fac2.03.blastresult 1066 1066 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 10 ############## # Danio_rerio.glob01.24.minQN1.fac2.01.blastresult 8343 8343 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 24 ############## # Danio_rerio.glob08.14.minQN1.fac2.02.blastresult 1757 1757 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 14 14 25691233 25695169 2 23.3% 84.7% -1 134.4 NOMATCH:ENSDARG00000071571(ENSDARP00000096679 [cdx1a]); ##For comparison: OptHitEntry for p16=>ENSP00000370408=>CDX2_HUMAN maxScore=134.4(q1) ############## # Danio_rerio.glob07.10.minQN1.fac2.01.blastresult 1106 1106 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 10 ############## # Danio_rerio.glob23.7.minQN1.fac2.02.blastresult 1605 1605 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 7 ############## # Danio_rerio.glob04.14.minQN1.fac2.01.blastresult 837 837 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 14 ############## # Danio_rerio.glob02.5.minQN1.fac2.01.blastresult 2291 2291 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 5 ############## # Danio_rerio.glob05.21.minQN1.fac2.01.blastresult 1112 1112 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 21 ############## # Danio_rerio.glob12.14.minQN1.fac2.03.blastresult 1537 1537 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 14 14 37387121 37389654 3 68.1% 56.1% -1 217.2 NOMATCH:ENSDARG00000036292(ENSDARP00000052708 [cdx4]); ##For comparison: OptHitEntry for p16=>ENSP00000370408=>CDX2_HUMAN maxScore=217.2(q4) ############## # Danio_rerio.glob06.7.minQN1.fac2.01.blastresult 1404 1404 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 7 ############## # Danio_rerio.glob21.21.minQN1.fac2.02.blastresult 671 671 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 21 ############## # Danio_rerio.glob46.16.minQN1.fac2.02.blastresult 111 111 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 16 ############## # Danio_rerio.glob43.15.minQN1.fac2.01.blastresult 406 406 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 15 ############## # Danio_rerio.glob14.22.minQN1.fac2.01.blastresult 744 744 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 22 ############## # Danio_rerio.glob17.24.minQN1.fac2.02.blastresult 99 99 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 24 ############## # Danio_rerio.glob36.1.minQN1.fac2.02.blastresult 71 71 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 1 ############## # Danio_rerio.glob60.7.minQN1.fac2.03.blastresult 215 215 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 7 ############## # Danio_rerio.glob20.12.minQN1.fac2.01.blastresult 199 199 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 12 ############## # Danio_rerio.glob16.16.minQN1.fac2.01.blastresult 187 187 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 16 ############## # Danio_rerio.glob58.11.minQN1.fac2.02.blastresult 326 326 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 11 ############## # Danio_rerio.glob35.18.minQN1.fac2.01.blastresult 150 150 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 18 ############## # Danio_rerio.glob29.13.minQN1.fac2.01.blastresult 141 141 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 13 ############## # Danio_rerio.glob11.6.minQN1.fac2.01.blastresult 104 104 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 6 ############## # Danio_rerio.glob50.13.minQN1.fac2.02.blastresult 113 113 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 13 ############## # Danio_rerio.glob45.21.minQN1.fac2.03.blastresult 1055 1055 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 21 ############## # Danio_rerio.glob39.17.minQN1.fac2.01.blastresult 91 91 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 17 ############## # Danio_rerio.glob25.9.minQN1.fac2.02.blastresult 365 365 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 9 ############## # Danio_rerio.glob27.23.minQN1.fac2.01.blastresult 336 336 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 23 ############## # Danio_rerio.glob47.23.minQN1.fac2.02.blastresult 89 89 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 23 ############## # Danio_rerio.glob32.6.minQN1.fac2.02.blastresult 234 234 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 6 ############## # Danio_rerio.glob09.20.minQN1.fac2.02.blastresult 1083 1083 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 20 ############## # Danio_rerio.glob42.17.minQN1.fac2.02.blastresult 237 237 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 17 ############## # Danio_rerio.glob48.14.minQN1.fac2.04.blastresult 69 69 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 14 ############## # Danio_rerio.glob52.2.minQN1.fac2.04.blastresult 584 584 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 2 ############## # Danio_rerio.glob57.1.minQN1.fac2.04.blastresult 436 436 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 1 ############## # Danio_rerio.glob10.10.minQN1.fac2.02.blastresult 402 402 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 10 ############## # Danio_rerio.glob51.8.minQN1.fac2.02.blastresult 178 178 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 8 ############## # Danio_rerio.glob33.25.minQN1.fac2.01.blastresult 267 267 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 25 ############## # Danio_rerio.glob53.20.minQN1.fac2.04.blastresult 236 236 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 20 ############## # Danio_rerio.glob03.20.minQN1.fac2.01.blastresult 1922 1922 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 20 ############## # Danio_rerio.glob24.20.minQN1.fac2.03.blastresult 1014 1014 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 20 ############## # Danio_rerio.glob18.3.minQN1.fac2.01.blastresult 413 413 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 3 ############## # Danio_rerio.glob26.2.minQN1.fac2.01.blastresult 348 348 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 2 ############## # Danio_rerio.glob31.2.minQN1.fac2.02.blastresult 318 318 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 2 ############## # Danio_rerio.glob34.2.minQN1.fac2.03.blastresult 415 415 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 2 ############## # Danio_rerio.glob30.22.minQN1.fac2.02.blastresult 347 347 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 22 ############## # Danio_rerio.glob40.11.minQN1.fac2.01.blastresult 178 178 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 11 ############## # Danio_rerio.glob56.24.minQN1.fac2.03.blastresult 410 410 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 24 ############## # Danio_rerio.glob44.18.minQN1.fac2.03.blastresult 218 218 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 18 ############## # Danio_rerio.glob22.19.minQN1.fac2.02.blastresult 310 310 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 19 ############## # Danio_rerio.glob41.18.minQN1.fac2.02.blastresult 318 318 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 18 ############## # Danio_rerio.glob13.19.minQN1.fac2.01.blastresult 1084 1084 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 19 ############## # Danio_rerio.glob49.17.minQN1.fac2.03.blastresult 251 251 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 17 ############## # Danio_rerio.glob54.8.minQN1.fac2.03.blastresult 479 479 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 8 ############## # Danio_rerio.glob59.11.minQN1.fac2.03.blastresult 142 142 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 11 ############## # Danio_rerio.glob19.9.minQN1.fac2.01.blastresult 211 211 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 9 ############## # Danio_rerio.glob28.1.minQN1.fac2.01.blastresult 295 295 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 1 ############## # Danio_rerio.glob15.8.minQN1.fac2.01.blastresult 660 660 C1_CDX2_ENSG00000165556_2e6.protein.info Danio_rerio 8