# STOCKHOLM 1.0          BACTERIAL Met
#=GC CS                                                                             2244654..322............223.56434.......43465.....3662.........26634564422....
#=GC BP                                                                             +++++++..++++..........++++.+++++.......+++++.....+++++.......++++++++++++....
tdbD1796|Acholeplasma_laidlawii|2148|Met|CAT                                        CGCGGGATAGAGCAGTCTGGT-AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGTCGATGGTTCAAATCCATCTCCCGCAACCA
tdbD7740|Acinetobacter_sp._ADP1|62977|Met|CAT                                       GGCTATGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACCGCACTCATAATGCGGGGGTCACAGGTTCAAGTCCCGTCATAGCCACCA
tdbD7408|Agrobacterium_tumefaciens_str._C58|176299|Met|CAT                          CGCGGGGTGGAGCAGCCCGGT-AGCTCGTCAGGCTCATAACCTGAAGGCCGCAGGTTCAAATCCTGCCCCCGCAACCA
tdbD7370|Aquifex_aeolicus_VF5|224324|Met|CAT                                        GGCGGCGTAGCTCAGCT-GGTCAGAGCGGGGATCTCATAAGTCCCAGGTCGGAGGTTCGAGTCCTCCCGCCGCCACCA
tdbD7741|Bacillus_anthracis_str._A2012|191218|Met|CAT                               GGACCCTTAGCTCAGCT-GGTTAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCA---
tdbD7648|Bacillus_anthracis_str._Ames|198094|Met|CAT                                GGACCCTTAGCTCAGCT-GGTTAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCA---
tdbD7685|Bacillus_anthracis_str._Sterne|260799|Met|CAT                              GGACCCTTAGCTCAGCT-GGTTAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCA---
tdbD7718|Bacillus_cereus_ATCC_10987|222523|Met|CAT                                  GGACCCTTAGCTCAGCT-GGTTAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCA---
tdbD7614|Bacillus_cereus_ATCC_14579|226900|Met|CAT                                  GGACCCTTAGCTCAGCT-GGTTAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCA---
tdbD7568|Bacillus_halodurans_C-125|272558|Met|CAT                                   CGCGGGGTGGAGCAGTCTGGT-AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGTCGGCGGTTCAAATCCGTCCCCCGCAA---
tdbD7299|Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168|224308|Met|CAT                  GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCACCA
tdbD7744|Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27|281309|Met|CAT         GGACCCTTAGCTCAGCT-GGTTAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAGGGTCCA---
tdbD7638|Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482|226186|Met|CAT                       GGCGGGATAGCTCAGCT-GGTTAGAGCGCATGATTCATAATCATGAGGTCCCCGGTTCAATCCCGGGTCCCGCTA---
tdbD7652|Bartonella_henselae_str._Houston-1|283166|Met|CAT                          GGGCCTGTAGCTCAATT-GGTTAGAGCCAGCGGCTCATAACCGCTTGGTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCCCACCA
tdbD7750|Bartonella_quintana_str._Toulouse|283165|Met|CAT                           GGGCCTGTAGCTCAATT-GGTTAGAGCCAGCGGCTCATAACCGCTTGGTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCCCACCA
tdbD7657|Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100|264462|Met|CAT                            GGTGGGGTAGCTCAGCT-GGTTAGAGCAACGGAATCATAATCCGTAGGTCGGCGGTTCAAGTCCGCCTCTCACTACCA
tdbD7535|Bifidobacterium_longum_NCC2705|206672|Met|CAT                              GGGGCCGTAGCTCAGTC-GGTTAGAGCATGCGACTCATAATCGCCCGGTCCAGGGTTCAAGCCCCTGCGGCCCCA---
tdbD7343|Borrelia_burgdorferi_B31|224326|Met|CAT                                    GGGCCCATAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACCCGACTCATAATCGGTAGGTCCCAGGTTCAAGTCCTGGTGGGCCCA---
tdbD7689|Borrelia_garinii_PBi|290434|Met|CAT                                        GGGCCCATAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACCCGACTCATAATCGGTAGGTCCCAGGTTCAAGTCCTGGTGGGCCCA---
tdbD7570|Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110|224911|Met|CAT                           GGGCCTGTAGCTCAAT--GGTTAGAGCCGGCCGCTCATAACGGTCTGGTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCCCACCA
tdbD7393|Brucella_melitensis_16M|224914|Met|CAT                                     GGCGGAGTAGCTCAGTA-GGTTAGAGCAGAGGAATCATAATCCTTGTGTCGGGGGTTCGAATCCCTCCTCCGCTACCA
tdbD7537|Brucella_suis_1330|204722|Met|CAT                                          GGCGGAGTAGCTCAGTA-GGTTAGAGCAGAGGAATCATAATCCTTGTGTCGGGGGTTCGAATCCCTCCTCCGCTACCA
tdbD7300|Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum)|107806|Met|CAT          GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTAAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGTCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCA---
tdbD7619|Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae)|224915|Met|CAT           GGCCTCTTAGCTCAGT--GGTAAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGTCGCTGGTTCAAATCCAGCAGGGGCCA---
tdbD7495|Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum)|198804|Met|CAT           GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTCAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGTCGCTGGTTCAAATCCAGCAAGGGCCA---
tdbD7345|Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168|192222|Met|CAT               GGATTTATAGCTCAGTT-GGTTAGAGCAACCGGCTCATAACCGGTTGGTCGCAGGTTCGAGTCCTGCTAAATCCACCA
tdbD7751|Candidatus_Blochmannia_floridanus|203907|Met|CAT                           GGCTACGTAGCTCAGAT-GGTTAGAGCGCAGCACTCATAATGCTGAGGGCACAGGTTCAAATCCTGTCGTAGCTA---
tdbD7667|Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25|264201|Met|CAT                 GGGGCAATAGCTCAGT--GGTTAGAGCAGCGGACTCATAACCCGCTGGTCGTAGGTTCAAATCCTACTTGCCCCA---
tdbD7347|Caulobacter_crescentus_CB15|190650|Met|CAT                                 GGGCCTGTAGCTCAAT--GGTTAGAGCCGACCGCTCATAACGGTCTGGTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCCTACCA
tdbD7383|Chlamydia_muridarum_Nigg|243161|Met|CAT                                    GGGGCAATAGCTCAGC--GGTTAGAGCTGCGGACTCATAACCCGTAGGTCCCTGGTTCAAATCCAGGTTGCCCCA---
tdbD7295|Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX|272561|Met|CAT                             GGGGCAATAGCTCAGC--GGTTAGAGCTGCGGACTCATAACCCGTAGGTCCCTGGTTCAAATCCAGGTTGCCCCA---
tdbD7291|Chlamydophila_pneumoniae_AR39|115711|Met|CAT                               GGGGCGGTAGCTCAGT--GGTTAGAGCTGCGGACTCATAACCCGTAGGTCACAGGTTCAAATCCTGTCCGCCCCA---
tdbD7293|Chlamydophila_pneumoniae_CWL029|115713|Met|CAT                             GGGGCGGTAGCTCAGT--GGTTAGAGCTGCGGACTCATAACCCGTAGGTCACAGGTTCAAATCCTGTCCGCCCCA---
tdbD7318|Chlamydophila_pneumoniae_J138|138677|Met|CAT                               GGGGCGGTAGCTCAGT--GGTTAGAGCTGCGGACTCATAACCCGTAGGTCACAGGTTCAAATCCTGTCCGCCCCA---
tdbD7486|Chlorobium_tepidum_TLS|194439|Met|CAT                                      GGTGAGGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACAGGATTCATAACCCTGAGGTCGAGGGTTCAACTCCCTCCCTCACCA---
tdbD7388|Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824|272562|Met|CAT                         GGATCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCAACCGGCTCATAACCGGTCGGTCCGGGGTTCGAGTCCCTGAAGGTCCACCA
tdbD7378|Clostridium_perfringens_str._13|195102|Met|CAT                             GGATCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCAACCGGCTCATAACCGGTAGGTCCGGGGTTCGAGTCCCTGAAGGTCCACCA
tdbD7573|Clostridium_tetani_E88|212717|Met|CAT                                      GGATCTTTAGCTCAGCT-GGTTAGAGCAACCGGCTCATAACCGGTAGGTCCGGGGTTCGAGTCCCTGAAGGTCCACCA
tdbD7658|Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129|257309|Met|CAT                      GGCGGTGTAGCTCAGT--GGT-AGAGCAAACGACTCATAATCGTTGTGTCGAGAGTTCAATTCTCTCCATCGCTA---
tdbD7541|Corynebacterium_efficiens_YS-314|196164|Met|CAT                            GGGGCTATAGCTCAGTC-GGTTAGAGCTACGGACTCATAATCCGTTGGTCGCGGGTTCGAGCCCCGCTGGCCCCA---
tdbD7499|Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032|196627|Met|CAT                       GGCGGTGTAGCTCAGT--GGT-AGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTA---
tdbD7611|Coxiella_burnetii_RSA_493|227377|Met|CAT                                   GGCTATGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACGGCATTCATAATGCCGGTGTCGGTGGTTCAAGTCCACCCATAGCCA---
tdbD7349|Deinococcus_radiodurans_R1|243230|Met|CAT                                  GGGCTCTTAGCTCAAC--GGTCAGAGCAGTCGGCTCATAACCGATTGGTTGCCGGTTCAAATCCGGCAGGGCCCACCA
tdbD7721|Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough|882|Met|CAT      GGGCCCATAGCTCAATT-GGC-AGAGCCCTCGGCTCATAACCGATTTGTTGCAGGTTCGAGTCCTGCTGGGCCCACCA
tdbD7577|Enterococcus_faecalis_V583|226185|Met|CAT                                  GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
tdbD7624|Escherichia_coli_CFT073|199310|Met|CAT                                     GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTTAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
tdbD7320|Escherichia_coli_K12|83333|Met|CAT                                         GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTTAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAAGGGCCACCA
tdbD7326|Escherichia_coli_O157:H7|83334|Met|CAT                                     GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTTAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
tdbD7332|Escherichia_coli_O157:H7_EDL933|155864|Met|CAT                             GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTTAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
tdbD7487|Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586|190304|Met|CAT         GGATCCATAGCTCAGTTTGGTCAGAGCACTCGGCTCATAACCGAGTGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCTGGATCCACCA
tdbD7694|Geobacter_sulfurreducens_PCA|243231|Met|CAT                                GGGCCTATAGCTCAGTT-GGCTAGAGCAACCGGCTCATAACCGGTCGGTCCCAGGTTCGAGTCCTGGTGGGCCCACCA
tdbD7340|Haemophilus_influenzae_Rd_KW20|71421|Met|CAT                               GGCTACATAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACAACACTCATAATGTTGGGGTCGCAAGTTCGAATCTCGCTGTAGCCACCA
tdbD7603|Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449|235279|Met|CAT                           CGCGGGATAGAGCAGTCCGGT-AGCTCGTTGGGCTCATAACCCAAAGGTCGGGGGTTCAAATCCCTCTCCCGCAACCA
tdbD7335|Helicobacter_pylori_26695|85962|Met|CAT                                    GGATTCTTAGCTCAGCT-GGTCAGAGCACTCGGCTCATAACCGATTGGTCGTAGGTTCAAGTCCTACAGAATCCACCA
tdbD7337|Helicobacter_pylori_J99|85963|Met|CAT                                      GGATTCTTAGCTCAGCT-GGTCAGAGCGCTCGGCTCATAACCGATTGGTCGTAGGTTCAAGTCCTACAGAATCCACCA
tdbD7696|Lactobacillus_johnsonii_NCC_533|257314|Met|CAT                             GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCGGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
tdbD7587|Lactobacillus_plantarum_WCFS1|220668|Met|CAT                               GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTCAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCTGTCGTTGGTTCGAGTCCAACAAGGTCCA---
tdbD7700|Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07|281090|Met|CAT                      GGGGCGGTAGCTCAGCT-GGTCAGAGCATCGGACTCATAATCCGCCGGTCACGGGTTCAAATCCCGTCCGCCCTA---
tdbD7543|Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601|189518|Met|CAT               GGGCCTATAGCTCAGTT-GGTTAGAGCGGCAGACTCATAATCTGCGGGTCGAAGGTTCAAGTCCTTCTGGGCCCA---
tdbD7372|Listeria_innocua_Clip11262|272626|Met|CAT                                  GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
tdbD7375|Listeria_monocytogenes_EGD-e|169963|Met|CAT                                GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
tdbD7723|Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365|265669|Met|CAT                        GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCAGACGGCTCATAACCGTCCGGTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
tdbD7725|Mesoplasma_florum_L1|265311|Met|CAT                                        GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCATCCGGCTCATAACCGGACGGTCATTGGTTCAAGTCCAATAAGGTCCACCA
tdbD7395|Mesorhizobium_loti_MAFF303099|266835|Met|CAT                               GGGCCTGTAGCTCAAT--GGTTAGAGCCGGCGGCTCATAACCGCTTGGTTGGGGGTTCGAGTCCCTCCGGGCCCACCA
tdbD7604|Mycobacterium_bovis_AF2122/97|233413|Met|CAT                               GGCGATGTAGCTCAGTC-GGTTAGAGCGAACGACTCATAATCGTTAGGTCGCCGGTTCGAGTCCGGCCATCGCTA---
tdbD7313|Mycobacterium_leprae_TN|272631|Met|CAT                                     GGCGATGTAGCTCAGTC-GGTTAGAGCGAACGACTCATAATCGTTAGGTCGCCGGTTCGAGTCCGGCCATCGCTA---
tdbD7302|Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551|83331|Met|CAT                           GGCGATGTAGCTCAGTC-GGTTAGAGCGAACGACTCATAATCGTTAGGTCGCCGGTTCGAGTCCGGCCATCGCTA---
tdbD7664|Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv|83332|Met|CAT                             GGCGATGTAGCTCAGTC-GGTTAGAGCGAACGACTCATAATCGTTAGGTCGCCGGTTCGAGTCCGGCCATCGCTA---
tdbD1790|Mycoplasma_capricolum|2095|Met|CAT                                         GGCGGGGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCGTTCGGTTCATACCCGAAAGGTCGAGAGTTCAAATCTCTCCCCCGCTACCA
tdbD7601|Mycoplasma_gallisepticum_R|233150|Met|CAT                                  GGATCTATAGCTCAAT--GGTTAGAGCCCCCGACTCATAATCGGTTGGTTACAGGTTCAAGTCCTGTTAGATCCACCA
tdbD7352|Mycoplasma_genitalium_G37|243273|Met|CAT                                   GGCTGGATACCTCAGTT-GGTTAGAGGGCCCGGTTCATACCCGGGTTGTCGTGAGTTCGAGTCTCACTCCAGCCACCA
tdbD1793|Mycoplasma_mycoides|2102|Met|CAT                                           GGCGGGGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCGTTCGGTTCATACCCGAAAGGTCGAGAGTTCAACTCTCTCCCCCGCTACCA
tdbD7354|Mycoplasma_pneumoniae_M129|272634|Met|CAT                                  GGCTGGATACCTCAGTT-GGTTAGAGGACCCGGTTCATACCCGGGTTGTCGTGAGTTCGAATCTCACTCCAGCCACCA
tdbD7407|Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP|272635|Met|CAT                                GGACCTATAACTCAAT--GGTTAGAGTACCCGGCTCATAACCGGTAGGTTGCTGGTTCAAGTCCAGCTGGGTCCACCA
tdbD7304|Neisseria_meningitidis_MC58|122586|Met|CAT                                 GGGTCTGTAGCTCAGG--GGTTAGAGCAGGGGACTCATAATCCCTTGGTCGTGGGTTCGAACCCCACCGGACCCACCA
tdbD7306|Neisseria_meningitidis_Z2491|122587|Met|CAT                                GGCGAATTAGCTCAGTC-GGTTAGAGCAGAGGAATCATAATCCTTGTGTCCGGGGTTCGAGTCCCTGATTCGCCACCA
tdbD7635|Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718|228410|Met|CAT                            GGGTCTGTAGCTCAGTT-GGTCAGAGCAGGGGACTCATAATCCCTTGGTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGACCCACCA
tdbD7404|Nostoc_sp._PCC_7120|103690|Met|CAT                                         GGCTCAGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACGGGACTCATAAGCCTGGGGTCGTTGGTTCAAATCCGACCTGAGCCA---
tdbD7544|Oceanobacillus_iheyensis_HTE831|221109|Met|CAT                             GGACCCTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCTATCGGCTCATAACCGATCGGTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAGGGTCCACCA
tdbD7662|Onion_yellows_phytoplasma_OY-M|262768|Met|CAT                              GGACCTGTAGCTCAGCT-GGTCAGAGCTACCGGCTCATAACCGGTTGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCGGGTCCACCA
tdbD7355|Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70|272843|Met|CAT            GCCCCCATAGCTCAGTC-GGTCAGAGCAGTCGACTCATAATCGATTGGTCACAGGTTCAAGTCCTGTTGGGGGCACCA
tdbD1808|Photobacterium_leiognathi|658|Met|CAT                                      GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACATCACTCATAATGATGGGGTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
tdbD7674|Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1|243265|Met|CAT              GGCCCCTTAGCTCAGTT-GGTCAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGTCACTGGTTCAAGTCCAGTAGGGGCCACCA
tdbD7702|Porphyromonas_gingivalis_W83|242619|Met|CAT                                GGTCCTATAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACCTGACTCATAATCAGGGAGTCCTTGGTTCAAGCCCAAGTGGGACCA---
tdbD7727|Propionibacterium_acnes_KPA171202|267747|Met|CAT                           GGGGCGTTAGCTCAGCC-GGTCAGAGCAGGGGACTCATAATCCCTGGGTCGCGGGTTCGAGCCCCGCACGCCCCA---
tdbD7360|Pseudomonas_aeruginosa_PAO1|208964|Met|CAT                                 GGGCCTATAGCTCAGTC-GGTTAGAGCAGAGGACTCATAATCCTTTGGTCCACGGTTCGAGTCCGTGTGGGCCCACCA
tdbD7641|Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000|223283|Met|CAT                 GGGCCCATAGCTCAGTT-GGTTAGAGCAGAGGACTCATAATCCTTTGGTCCACGGTTCGAGTCCGTGTGGGCCCACCA
tdbD7403|Ralstonia_solanacearum_GMI1000|267608|Met|CAT                              GGGCCTGTAGCTCAGG--GGTTAGAGCAGACGACTCATAATCGTTTGGTCGTGGGTTCGAAACCCACCGGGCCCACCA
tdbD7631|Rhodopirellula_baltica_SH_1|243090|Met|CAT                                 GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCTGGGAACTCATAATTCCTAGGTCGCGGGTTCAAGTCCTGCCAGCCCTA---
tdbD7677|Rhodopseudomonas_palustris_CGA009|258594|Met|CAT                           GGGCCTGTAGCTCAAT--GGTTAGAGCCGACCGCTCATAACGGTCTGGTTGCAGGTTCGAGTCCTGCCGGGCCCACCA
tdbD7391|Rickettsia_conorii_str._Malish_7|272944|Met|CAT                            GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACGCCGCTCATAACGGTGTGGTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGCCCCACCA
tdbD7498|Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E|272947|Met|CAT                         GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACGCCGCTCATAACGGTGTGGTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGCCCCACCA
tdbD7706|Rickettsia_typhi_str._Wilmington|257363|Met|CAT                            GGGGCTGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACGCCGCTCATAACGGTGTGGTCGTAGGTTCAAGTCCTACCAGCCCCACCA
tdbD7412|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18|220341|Met|CAT GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTTAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
tdbD7630|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2|209261|Met|CAT  GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTTAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
tdbD7401|Salmonella_typhimurium_LT2|99287|Met|CAT                                   GGCCCCTTAGCTCAGT--GGTTAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAGGGGCCACCA
tdbD7554|Shewanella_oneidensis_MR-1|211586|Met|CAT                                  GGCCCCTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACACGACTCATAATCGTTAGGTCCACGGTTCAAGTCCGTGAGGGGCCACCA
tdbD7560|Shigella_flexneri_2a_str._301|198214|Met|CAT                               GGCCCTTTAGCTCAGT--GGTTAGAGCAGGCGACTCATAATCGCTTGGTCGCTGGTTCAAGTCCAGCAAGGGCCACCA
tdbD7414|Sinorhizobium_meliloti_1021|266834|Met|CAT                                 GGCGGAGTAGCTCAGTA-GGTTAGAGCAGAGGAATCATAATCCTTGTGTCGGGGGTTCGAATCCCTCCTCCGCTACCA
tdbD1797|Spiroplasma_melliferum|2134|Met|CAT                                        GGCGGGATAGCTCAGCT-GGTTAGAGCGCTCGGCTCATACCCGGGAGGTCAAGAGTTCAAGTCTCTTTCTCGCTACCA
tdbD7680|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252|282458|Met|CAT                 GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCTAACGGCTCATAACCGTTCGGTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
tdbD7503|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2|196620|Met|CAT                     GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCTAACGGCTCATAACCGTTCGGTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
tdbD7311|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315|158879|Met|CAT                    GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCTAACGGCTCATAACCGTTCGGTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
tdbD7589|Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228|176280|Met|CAT                       GGACCTTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCTAACGGCTCATAACCGTTCGGTCGCAGGTTCGAGTCCTGCAAGGTCCA---
tdbD7563|Streptococcus_agalactiae_2603V/R|208435|Met|CAT                            GGACCTTTAGCTCAACT-GGTTAGAGCACTCGGCTCATAACCGAGCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
tdbD7506|Streptococcus_agalactiae_NEM316|211110|Met|CAT                             GGACCTTTAGCTCAACT-GGTTAGAGCACTCGGCTCATAACCGAGCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
tdbD7566|Streptococcus_mutans_UA159|210007|Met|CAT                                  GGACCTTTAGCTCAGCT-GGTTAGAGCACTCGGCTCATAACCGAGCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
tdbD7385|Streptococcus_pneumoniae_TIGR4|170187|Met|CAT                              GGACCTTTAGCTCAGCT-GGTTAGAGCTCTCGGCTCATAACCGAGTGGTCGTAGGTTCAAGTCCTACAAGGTCCA---
tdbD7384|Streptococcus_pyogenes_M1_GAS|160490|Met|CAT                               CGCGGGATGGAGCAGTTAGGT-AGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGTCGTAGGTTCAAATCCTGCTCCCGCAA---
tdbD7509|Streptococcus_pyogenes_MGAS315|198466|Met|CAT                              GGACCTTTAGCTCAACT-GGTTAGAGCACTCGGCTCATAACCGAGCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
tdbD7607|Streptococcus_pyogenes_SSI-1|193567|Met|CAT                                GGACCTTTAGCTCAACT-GGTTAGAGCACTCGGCTCATAACCGAGCGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACAAGGTCCA---
tdbD7627|Streptomyces_avermitilis_MA-4680|227882|Met|CAT                            GGGGCGGTAGCTCAGCC-GGTTAGAGCAGCGGACTCATAATCCGTCGGCCGTGGGTTCGAGTCCCACCCGCCCCA---
tdbD7550|Streptomyces_coelicolor_A3(2)|100226|Met|CAT                               GGGGCGGTAGCTCAGCC-GGTTAGAGCAGCGGACTCATAATCCGTCGGCCGTGGGTTCGAGTCCCACCCGCCCCA---
tdbD7709|Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863|292459|Met|CAT                      GGGCCCTTAGCTCAGC--GGTCAGAGCTGCCGGCTCATAACCGGTTGGTCGTAGGTTCGAATCCTACAGGGCCCACCA
tdbD7362|Synechocystis_sp._PCC_6803|1148|Met|CAT                                    GGCTTGGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCAGGGGACTCATAAGCCCAAGGTCGGCGGTTCAAATCCGCCCCGAGCCA---
tdbD7516|Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4|273068|Met|CAT                        GGGCCTTTAGCTCAGCT-GGC-AGAGCGGTCGGCTCATAACCGATTGGTCCGGGGTTCGAATCCCTGAAGGCCCACCA
tdbD7512|Thermosynechococcus_elongatus_BP-1|197221|Met|CAT                          GGCTCAGTAGCTCAGT--GGTTAGAGCAGGGGACTCATAAGCCCAAGGTCGCAGGTTCGAATCCCGCCTGAGCCA---
tdbD7363|Thermotoga_maritima_MSB8|243274|Met|CAT                                    GGCGGCGTAGCTCAGC--GGCGAGAGCGGGTGATTCATAATCACCGTGTCGTGGGTTCGAGTCCCACCGCCGCCA---
tdbD7729|Thermus_thermophilus_HB27|262724|Met|CAT                                   GGGCCGTTAGCTCAAC--GGTCAGAGCAGCCGGCTCATAACCGGTAGGTTGCAGGTTCGAATCCTGCACGGCCCACCA
tdbD7734|Treponema_denticola_ATCC_35405|243275|Met|CAT                              GGGCCCATAGCTCAGTT-GGTTAGAGCAGCGGACTCATAATCCGCGGGTCGCCGGTTCAAGTCCAGCTGGGCCCA---
tdbD7357|Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols|243276|Met|CAT             GGCGGCATAGCTCAGTT-GGT-AGAGCACGCGGCTCATATCCGCGCTGTCATAGGTTCAATCCCTATTGCCGCTA---
tdbD7592|Tropheryma_whipplei_str._Twist|203267|Met|CAT                              GGGGCGGTAGCTCAGCT-GGTTAGAGCTGCGAACTCATAATTCGTCGGTCACGGGTTCGAGTCCCGTCCGCCCCA---
tdbD7595|Tropheryma_whipplei_TW08/27|218496|Met|CAT                                 GGGGCGGTAGCTCAGCT-GGTTAGAGCTGCGAACTCATAATTCGTCGGTCACGGGTTCGAGTCCCGTCCGCCCCA---
tdbD7316|Ureaplasma_parvum_serovar_3|38504|Met|CAT                                  GCTTCTATAGCTCAATTTGGTTAGAGCCCCCGACTCATAATCGGTTGGTTACAGGTTCAAGTCCTGTTAGAAGCACCA
tdbD7309|Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961|243277|Met|CAT                GGCTACGTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACATCACTCATAATGATGGGGTCACAGGTTCGAATCCCGTCGTAGCCACCA
tdbD7735|Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster|163164|Met|CAT           GGCTGAGTAGCTCAGTT-GGT-AGAGCAGGAGGATCATAATCTCTTGGTCGGGGGTTCAAGTCCCTCCTCAGCCA---
tdbD7525|Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306|190486|Met|CAT                   GGGCCTATAGCTCAAC--GGTTAGAGCAGAGGACTCATAATCCTTTGGTTCCAGGTTCGAATCCTGGTGGGCCCACCA
tdbD7522|Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913|190485|Met|CAT       GGGCCTATAGCTCAAC--GGTTAGAGCAGAGGACTCATAATCCTTTGGTTCCAGGTTCGAATCCTGGTGGGCCCACCA
tdbD7366|Xylella_fastidiosa_9a5c|160492|Met|CAT                                     GGGCCTATAGCTCAATT-GGTTAGAGCAGCGGACTCATAATCCGTTGGTTGCAGGTTCAAGTCCTGCTGGGCCCACCA
tdbD7597|Xylella_fastidiosa_Temecula1|183190|Met|CAT                                GGGCCTATAGCTCAATT-GGTTAGAGCAGCGGACTCATAATCCGTTGGTTGCAGGTTCAAGTCCTGCTGGGCCCACCA
tdbD7712|Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001|229193|Met|CAT                  GGCCCCTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACGCGACTCATAATCGCTTGGTCACTGGTTCAAGTCCAGTAGGGGCCACCA
tdbD7397|Yersinia_pestis_CO92|214092|Met|CAT                                        GGCCCCTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACGCGACTCATAATCGCTTGGTCACTGGTTCAAGTCCAGTAGGGGCCACCA
tdbD7530|Yersinia_pestis_KIM|187410|Met|CAT                                         GGCCCCTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACGCGACTCATAATCGCTTGGTCACTGGTTCAAGTCCAGTAGGGGCCACCA
tdbD7715|Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953|273123|Met|CAT                        GGCCCCTTAGCTCAGTT-GGTTAGAGCACGCGACTCATAATCGCTTGGTCACTGGTTCAAGTCCAGTAGGGGCCACCA
#=GC SS_cons                                                                        (((((((..((((..........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
#=GC SN                                                                             0000000..1111..........1111.22222.......22222.....33333.......333330000000....

#=GF CS                                                                             78 columns, 21 paired, 19 covariant; 4 stems
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