# STOCKHOLM 1.0          BACTERIAL His
#=GC CS                                                                             .3335654..233............332.44325.......52344.......5433.........33454565333....
#=GC BP                                                                             .+++++++..++++..........++++.+++++.......+++++.......+++++.......++++++++++++....
tdbD981|Acholeplasma_laidlawii|2148|His|GTG                                         GGCGGTTGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCATCGGCTTGTGGCGCCGACA--CTCGGGGGTTCAATTCCCCTCGGCCGCCCCA
tdbD5818|Acinetobacter_sp._ADP1|62977|His|GTG                                       GGTGGATGTAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCATTCACCCCA
tdbD991|Aeromonas_hydrophila|644|His|GTG                                            GGTGGCTGTAGCTCAGTTGGT--AGAGTCCCGGATTGTGATTCCGGTT--GTCGTGGGTTCGAGCCCCATCAGCCACCCCA
tdbD5699|Agrobacterium_tumefaciens_str._C58|176299|His|GTG                          TGCGGTTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGCAGGTTTGTGGCACCTGAG--GTCGGTGGTTCGACCCCACTCAACCGTACCA
tdbD5681|Aquifex_aeolicus_VF5|224324|His|GTG                                        GGAGGGTGTAGCTCAGTTGGT--AGAGCGGGGGACTGTGGATCCCCGT--GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCACCCTCCCCA
tdbD5819|Bacillus_anthracis_str._A2012|191218|His|GTG                               -GCGGTTGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
tdbD5784|Bacillus_anthracis_str._Ames|198094|His|GTG                                GGCGGTTGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
tdbD5795|Bacillus_anthracis_str._Sterne|260799|His|GTG                              GGCGGTTGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
tdbD5808|Bacillus_cereus_ATCC_10987|222523|His|GTG                                  GGCGGTTGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
tdbD5774|Bacillus_cereus_ATCC_14579|226900|His|GTG                                  GGCGGTTGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
tdbD5759|Bacillus_halodurans_C-125|272558|His|GTG                                   GGCGACTGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA--CTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
tdbD5652|Bacillus_subtilis_subsp._subtilis_str._168|224308|His|GTG                  GGCGGTTGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCAGATTGTGGCTCTGGCA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAATCGCCCCA
tdbD5820|Bacillus_thuringiensis_serovar_konkukian_str._97-27|281309|His|GTG         GGCGGTTGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCAGTCGCCCCA
tdbD5782|Bacteroides_thetaiotaomicron_VPI-5482|226186|His|GTG                       GGTGGATGTAGTTCAGTTGGTT-AGAGCGTCAGATTGTGGTTCTGAAT--GTCGCCGGTTCGAGTCCGGTCTTCCACC---
tdbD5785|Bartonella_henselae_str._Houston-1|283166|His|GTG                          TGCGGTTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGCTGGTTTGTGGCACCAGAG--GTCGTAGGTTCGAATCCCACCAACCGTACCA
tdbD5822|Bartonella_quintana_str._Toulouse|283165|His|GTG                           TGCGGTTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGCTGGTTTGTGGCACCAGAG--GTCGTAGGTTCGAATCCCACCAACCGTACCA
tdbD5786|Bdellovibrio_bacteriovorus_HD100|264462|His|GTG                            GGTGGGTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCATCGGATTGTGATTCCGAGT--GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTTACTCACCCCA
tdbD5748|Bifidobacterium_longum_NCC2705|206672|His|GTG                              GGTGGCCATAGCTCAGTTGGT--AGAGCATCTGATTGTGGTTCAGAAG--GTCGCGCGTTCGAGCCGCGTTGGCCACCCCA
tdbD5669|Borrelia_burgdorferi_B31|224326|His|GTG                                    GGTGGTTGTAGCTCAGTTGGT--AGAGCGTCGGGTTGTGGTTCCGAAT--GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCAATCACC---
tdbD5796|Borrelia_garinii_PBi|290434|His|GTG                                        GGTGGTTGTAGCTCAGTTGGT--AGAGCGTCGGGTTGTGGTTCCGAAT--GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCAATCACC---
tdbD5760|Bradyrhizobium_japonicum_USDA_110|224911|His|GTG                           TGCAGTTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGCCTGTCTGTGGAACAGGAG--GTCGGTGGTTCGAGCCCACCCAACTGTACCA
tdbD5692|Brucella_melitensis_16M|224914|His|GTG                                     CGCGGTCGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGCAGGATTGTGGCTCCTGAG--GTCGTTGGTTCAACTCCAACCGACCGTACCA
tdbD5749|Brucella_suis_1330|204722|His|GTG                                          CGCGGTCGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGCAGGATTGTGGCTCCTGAG--GTCGTTGGTTCAACTCCAACCGACCGTACCA
tdbD5653|Buchnera_aphidicola_str._APS_(Acyrthosiphon_pisum)|107806|His|GTG          GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGTGCTGGATTGTGATTCCAGTG--GTCATGGGTTCAAGTCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5775|Buchnera_aphidicola_str._Bp_(Baizongia_pistaciae)|224915|His|GTG           GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGTCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCATGGGTTCAAGTCCCATTAGCCACC---
tdbD5733|Buchnera_aphidicola_str._Sg_(Schizaphis_graminum)|198804|His|GTG           GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGTTCTGGATTGTGATTCCAGTG--GTCATGGGTTCAAATCCCATTAGCCACC---
tdbD5670|Campylobacter_jejuni_subsp._jejuni_NCTC_11168|192222|His|GTG               GGTGAGTGTAGCTCAGTCGGTT-AGAGCATCAGATTGTGGTCCTGAGG--GTCGTGGGTTCAATTCCCATCACTCACCCCA
tdbD5823|Candidatus_Blochmannia_floridanus|203907|His|GTG                           GGTGATTGTAGCTCAGTTGGT--AGAGCTCTGGATTGTGGTTCCAGTG--GTCGTGGGTTCGAATCCCATCAGTCACC---
tdbD5790|Candidatus_Protochlamydia_amoebophila_UWE25|264201|His|GTG                 GGCGGTCGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGTTGGATTGTGGTTCCAAAT--GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCGATCGCC---
tdbD5671|Caulobacter_crescentus_CB15|190650|His|GTG                                 AGCCGGCTTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGCTAGATTGTGGATCTAGAG--GTCCTCGGTTCGAGCCCGAGAGCTGGTACCA
tdbD5687|Chlamydia_muridarum_Nigg|243161|His|GTG                                    GGCGAACGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGTCGGATTGTGGTTCCGAAG--GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCGTTCGCC---
tdbD5649|Chlamydia_trachomatis_D/UW-3/CX|272561|His|GTG                             GGCGAACGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGTCGGATTGTGGTTCCGAAG--GTCGCGGGTTCGAACCCCGTCGTTCGCC---
tdbD5647|Chlamydophila_pneumoniae_AR39|115711|His|GTG                               GGCGAACGTAGCTCAGCTGGTT-AGAGCGTCGGATTGTGGTTCCGAAG--GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCGTTCGCC---
tdbD5648|Chlamydophila_pneumoniae_CWL029|115713|His|GTG                             GGCGAACGTAGCTCAGCTGGTT-AGAGCGTCGGATTGTGGTTCCGAAG--GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCGTTCGCC---
tdbD5662|Chlamydophila_pneumoniae_J138|138677|His|GTG                               GGCGAACGTAGCTCAGCTGGTT-AGAGCGTCGGATTGTGGTTCCGAAG--GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTCGTTCGCC---
tdbD5730|Chlorobium_tepidum_TLS|194439|His|GTG                                      GGTGATTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGCCAGGTTGTGGCCCTGGAG--GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCATTCACCCCG
tdbD5690|Clostridium_acetobutylicum_ATCC_824|272562|His|GTG                         GGTGGGTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCGCCAGATTGTGGTTCTGGAT--GTCTAGGGTTCGAGACCCTATATTCACC---
tdbD5686|Clostridium_perfringens_str._13|195102|His|GTG                             GGTGGGCGTAGTTCAGTTGGT--AGAGCACCAGATTGTGGCTCTGGGT--GTCGCGAGTTCGAGTCTCGTCGCTCACCCCA
tdbD5761|Clostridium_tetani_E88|212717|His|GTG                                      GGTGGGTATAGCTCAGGTGGT--AGAGCGCCAGATTGTGGTTCTGGAT--GCCAAGGGTTCGAGTCCCTTTATCCACCCCA
tdbD5787|Corynebacterium_diphtheriae_NCTC_13129|257309|His|GTG                      GGTGGCTGTAGTTCAGCTGGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT--GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCAGCCACC---
tdbD5750|Corynebacterium_efficiens_YS-314|196164|His|GTG                            GGTGGCTGTAGTTCAGCTGGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT--GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCAGCCACC---
tdbD5735|Corynebacterium_glutamicum_ATCC_13032|196627|His|GTG                       GGTGGCTGTAGTTCAGCTGGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT--GTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCAGCCACC---
tdbD5773|Coxiella_burnetii_RSA_493|227377|His|GTG                                   GGTGGGCGTAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCCGGATTGTGATTCCGGTT--GTCGTGGGTTCAAGTCCCATCGTCCACCCCA
tdbD5672|Deinococcus_radiodurans_R1|243230|His|GTG                                  GGTGGAATTAGCTCAGTCGGTT-AGAGCGCCGCTCTGTGGAAGCGGAG--GCCGTGGGTTCAAGTCCCATATTCCACCCCA
tdbD5810|Desulfovibrio_vulgaris_subsp._vulgaris_str._Hildenborough|882|His|GTG      GGCGGATGTAGCTCAGCAGGT--AGAGCACCTGGTTGTGGCCCAGGTG--GCCGTGGGTTCAAGTCCCATCATTCGCCCCA
tdbD5762|Enterococcus_faecalis_V583|226185|His|GTG                                  GGCGATCGTGGTGAAGT-GGTT-AACACACCAGATTGTGGCTCTGGCA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCGGTCGCC---
tdbD5776|Escherichia_coli_CFT073|199310|His|GTG                                     GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5663|Escherichia_coli_K12|83333|His|GTG                                         GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5664|Escherichia_coli_O157:H7|83334|His|GTG                                     GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5665|Escherichia_coli_O157:H7_EDL933|155864|His|GTG                             GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5731|Fusobacterium_nucleatum_subsp._nucleatum_ATCC_25586|190304|His|GTG         GGTGACCGTAGTTCAGTTGGT--AGAGCGCCAGTTTGTGGCACTGGTT--GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTCGGTCACCCCA
tdbD5797|Geobacter_sulfurreducens_PCA|243231|His|GTG                                GGTGGCTATGGTGAAGG-GGTCTAACACACATGACTGTGACTCATGCA--TTCGTGGGTTCAAATCCCACTAGCCACCCCA
tdbD5668|Haemophilus_influenzae_Rd_KW20|71421|His|GTG                               GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5770|Helicobacter_hepaticus_ATCC_51449|235279|His|GTG                           GGTGGGTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCATCAGGTTGTGGCTCTGAGG--GTCGTGGGTTCGAGCCCCATCTCCCACCCCA
tdbD5666|Helicobacter_pylori_26695|85962|His|GTG                                    GGTGGGAGTAGCTCAGTCGGTT-AGAGCATCAGATTGTGGTCCTGAGG--GTCGTGGGTTCGATTCCCATCTTCCACCCCA
tdbD5667|Helicobacter_pylori_J99|85963|His|GTG                                      GGTGGGAGTAGCTCAGTCGGTT-AGAGCATCAGATTGTGGTCCTGAGG--GTCGTGGGTTCGATTCCCATCTTCCACCCCA
tdbD5798|Lactobacillus_johnsonii_NCC_533|257314|His|GTG                             GGCGGAATTGGTGAAGT-GGTT-AACACACCGGTTTGTGGATCCGGCA--TGCGTGGGTTCGATCCCCACATTCCGCC---
tdbD5763|Lactobacillus_plantarum_WCFS1|220668|His|GTG                               GGCGGTAGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA--CGCGTGGGTTCGATTCCCACCTACCGCC---
tdbD5799|Leifsonia_xyli_subsp._xyli_str._CTCB07|281090|His|GTG                      GGTGGGTATAGCTCAGCTGGT--AGAGCGCCTGGTTGTGGTCCAGGAG--GTCGCGGGTTCAAGCCCCGTTACTCACCCCA
tdbD5751|Leptospira_interrogans_serovar_Lai_str._56601|189518|His|GTG               GGAGAACGTAGCTCAGTTGGT--AGAGCTCCAGTTTGTGGTACTGGCC--GTCGCGGGTTCGATTCCCGTCGTTCTCCCCA
tdbD5683|Listeria_innocua_Clip11262|272626|His|GTG                                  GGCGGATGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCTGATTGTGGTTCAGGCA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCATCCGCC---
tdbD5685|Listeria_monocytogenes_EGD-e|169963|His|GTG                                GGCGGATGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCTGATTGTGGTTCAGGCA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCATCCGCC---
tdbD5812|Listeria_monocytogenes_str._4b_F2365|265669|His|GTG                        GGCGGATGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCTGATTGTGGTTCAGGCA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCATCCGCC---
tdbD5813|Mesoplasma_florum_L1|265311|His|GTG                                        GGCGCCGGTGGTGAAGT-GGTT-AACACATCAGGTTGTGGCTCTGACA--TTCGCGGGTTCGATTCCCGTTCGGCGCCCCA
tdbD5693|Mesorhizobium_loti_MAFF303099|266835|His|GTG                               TGCCGTTGTAGCTCAGCTGGTT-AGAGCGCCGGATTGTGGATCCGGAG--GTCGCTGGTTCGATCCCAGCCAACGGTACCA
tdbD5771|Mycobacterium_bovis_AF2122/97|233413|His|GTG                               GGTGAGTGTAGTTCAGTTGGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT--GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCACTCACCCCA
tdbD5660|Mycobacterium_leprae_TN|272631|His|GTG                                     GGTGAGTGTAGTTCAGTTGGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT--GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCACTCACCCCA
tdbD5654|Mycobacterium_tuberculosis_CDC1551|83331|His|GTG                           GGTGAGTGTAGTTCAGTTGGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT--GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCACTCACCCCA
tdbD5789|Mycobacterium_tuberculosis_H37Rv|83332|His|GTG                             GGTGAGTGTAGTTCAGTTGGT--AGAGCACCAGGTTGTGATCCTGGGT--GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCACTCACCCCA
tdbD978|Mycoplasma_capricolum|2095|His|GTG                                          GGCGTAGGTGGTGAAGT-GGTT-AACACATCAGGTTGTGGCTCTGACA--TACGCGGGTTCGATCCCCGTTCTACGCCCCA
tdbD5769|Mycoplasma_gallisepticum_R|233150|His|GTG                                  GGCGGTTGTGGCGAAGC-GGTTTAACGCACCTGACTGTGAATCAGGCA--TGCACGGGTTCAAATCCCGTCAATCGCCCCA
tdbD5673|Mycoplasma_genitalium_G37|243273|His|GTG                                   GGCGATTGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCTGATTGTGGATCAGGCA--TTCGTGGGTTCAATTCCCATCAGTCGCCCCA
tdbD5674|Mycoplasma_pneumoniae_M129|272634|His|GTG                                  GGCGATTGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCTGATTGTGGATCAGGCA--TTCGTGGGTTCAATTCCCATCAGTCGCCCCA
tdbD5698|Mycoplasma_pulmonis_UAB_CTIP|272635|His|GTG                                GGTGAATATGGCGAAGG-GGTC-AACGCATCGGGTTGTGGTTCCGACA--TTCGCGGGTTCGAATCCCGTTATTCACCCCA
tdbD5655|Neisseria_meningitidis_MC58|122586|His|GTG                                 GGTGGCTGTAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCCGGATTGTGATTCCGGTT--GTCGTGGGTTCGAGCCCCATCAGCCACCCCA
tdbD5656|Neisseria_meningitidis_Z2491|122587|His|GTG                                GGTGGCTGTAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCCGGATTGTGATTCCGGTT--GTCGTGGGTTCGAGCCCCATCAGCCACCCCA
tdbD5781|Nitrosomonas_europaea_ATCC_19718|228410|His|GTG                            GGTGGCTGTAGCTCAGTTGGT--AGAGTCCCGGATTGTGATTCCGGTT--GTCGTGGGTTCGAGTCCCATCAGCCACCCCA
tdbD5697|Nostoc_sp._PCC_7120|103690|His|GTG                                         GGCGGGCGTAGCCAAGT-GGTT-AAGGCAGTGGATTGTGGTTCCACCA--TTCGGGGGTTCAAGTCCCCTCGTTCGCC---
tdbD5753|Oceanobacillus_iheyensis_HTE831|221109|His|GTG                             GGCGGTCGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCACCGGATTGTGGCTCCGGCA--CACGTGGGTTCGATCCCCATCGATCGCC---
tdbD5788|Onion_yellows_phytoplasma_OY-M|262768|His|GTG                              GGCGGTTATGGCGAAGT-GGTT-AACGCGGCGGCTTGTGGCGCCGATA--TGCGTGGGTTCGATTCCCACTAGCCGCCCCA
tdbD5675|Pasteurella_multocida_subsp._multocida_str._Pm70|272843|His|GTG            GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCCGGATTGTGATTCCGGTT--GTCGTGGGTTCAAGTCCCATTAGCCACCCCA
tdbD990|Photobacterium_phosphoreum|659|His|GTG                                      GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGTCCCGGATTGTGATTCCGGTT--GTCGCGAGTTCAAGCCTCGTTAGCCACCCCA
tdbD5791|Photorhabdus_luminescens_subsp._laumondii_TTO1|243265|His|GTG              GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAGTCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5800|Porphyromonas_gingivalis_W83|242619|His|GTG                                GGTGGGCGTAGTTCAGT-GGT--AGAGCAACGGATTGTGGTTCCGTCT--GTCGTGGGTTCGAGTCCCATCGTCCACCCCA
tdbD5814|Propionibacterium_acnes_KPA171202|267747|His|GTG                           GGTGGCTATAGCTCAGTCGGT--AGAGCACCTGGTTGTGGTCCAGGGG--GTCGCGGGTTCAAGTCCCGTTAGCCACCCCA
tdbD5677|Pseudomonas_aeruginosa_PAO1|208964|His|GTG                                 GGTGGGCGTAGCTCAGTTGGT--AGAGCACAGGATTGTGGCTCCTGGT--GTCGTGGGTTCGATTCCCATCGTCCACCCCA
tdbD5783|Pseudomonas_syringae_pv._tomato_str._DC3000|223283|His|GTG                 GGTGGGCGTAGCTCAGTTGGT--AGAGCACAGGATTGTGACTCCTGCG--GTCGTGGGTTCGAACCCCATCGTCCACCCCA
tdbD5696|Ralstonia_solanacearum_GMI1000|267608|His|GTG                              GGTGGCTGTAGCTCAGTTGGT--AGAGTCCCAGATTGTGATTCTGGTC--GTCGTGGGTTCGAGTCCCATCAGCCACCCCA
tdbD5780|Rhodopirellula_baltica_SH_1|243090|His|GTG                                 GGTGGTTGTAGTTCAGTTGGTT-AGAACGTCGGATTGTGATTCCGAAG--GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCCACC---
tdbD5792|Rhodopseudomonas_palustris_CGA009|258594|His|GTG                           TGCAGTTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGCCTGTCTGTGGAACAGGAG--GTCGGTGGTTCGAGCCCACCCAACTGTACCA
tdbD5691|Rickettsia_conorii_str._Malish_7|272944|His|GTG                            GGCGGGTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCATCAGGTTGTGGTTCTGAGG--GTCGCGGGTTCGAATCCCGTCACTCGCCCCA
tdbD5734|Rickettsia_prowazekii_str._Madrid_E|272947|His|GTG                         GGCGAGTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCATCAGGTTGTGGTTCTGAGG--GCCACGGGTTCGAATCCCGTCACTCGCCCCA
tdbD5801|Rickettsia_typhi_str._Wilmington|257363|His|GTG                            GGCGAGTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCATCAGGTTGTGGTTCTGAGG--GCCACGGGTTCGAATCCCGTCACTCGCCCCA
tdbD5700|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._CT18|220341|His|GTG GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5778|Salmonella_enterica_subsp._enterica_serovar_Typhi_str._Ty2|209261|His|GTG  GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5695|Salmonella_typhimurium_LT2|99287|His|GTG                                   GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5755|Shewanella_oneidensis_MR-1|211586|His|GTG                                  GGTGATTGTAGCTCAGTTGGT--AGAGTCCCGGATTGTGATTCCGGTT--GTCGTGGGTTCGAGCCCCATCAGTCACCCCA
tdbD5756|Shigella_flexneri_2a_str._301|198214|His|GTG                               GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5701|Sinorhizobium_meliloti_1021|266834|His|GTG                                 TGCGGTTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGCGCAGGTTTGTGGCACCTGAG--GTCGGAGGTTCGATCCCCCCCAACCGTACCA
tdbD5794|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MRSA252|282458|His|GTG                 GGCGGCTGTGGTGAAGT-GGTT-AACACATCGGATTGTGGTTCCGACA--TTCGAGGGTTCGATCCCCTTCAGCCGCC---
tdbD5737|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_MW2|196620|His|GTG                     GGCGGCTGTGGTGAAGT-GGTT-AACACATCGGATTGTGGTTCCGACA--TTCGAGGGTTCGATCCCCTTCAGCCGCC---
tdbD5658|Staphylococcus_aureus_subsp._aureus_N315|158879|His|GTG                    GGCGGCTGTGGTGAAGT-GGTT-AACACATCGGATTGTGGTTCCGACA--TTCGAGGGTTCGATCCCCTTCAGCCGCC---
tdbD5765|Staphylococcus_epidermidis_ATCC_12228|176280|His|GTG                       GGCGGTTGTGGCGAAGT-GGTT-AACGCATCGGATTGTGGTTCCGACA--CTCGAGGGTTCGATTCCCTTCAACCGCC---
tdbD5757|Streptococcus_agalactiae_2603V/R|208435|His|GTG                            GGCGGGTGTGGTGAAGT-GGTT-AACACATCAGATTGTGGCTCTGACA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCACTCGCC---
tdbD5738|Streptococcus_agalactiae_NEM316|211110|His|GTG                             GGCGGGTGTGGTGAAGT-GGTT-AACACATCAGATTGTGGCTCTGACA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCACTCGCC---
tdbD5758|Streptococcus_mutans_UA159|210007|His|GTG                                  GGCGGGTGTGGTGAAGT-GGTT-AACACACCAGATTGTGGCTCTGGCA--TGCGTGGGTTCGATCCCCATCACTCGCC---
tdbD5689|Streptococcus_pneumoniae_TIGR4|170187|His|GTG                              GGCGGGTGTGGTGAAGT-GGTT-AACACACCAGATTGTGGCTCTGGCA--TGCGTGGGTTCGATCCCCATCACTCGCC---
tdbD5688|Streptococcus_pyogenes_M1_GAS|160490|His|GTG                               GGCGGGTGTGGTGAAGT-GGTT-AACACATCAGATTGTGGCTCTGACA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCACTCGCC---
tdbD5739|Streptococcus_pyogenes_MGAS315|198466|His|GTG                              GGCGGGTGTGGTGAAGT-GGTT-AACACATCAGATTGTGGCTCTGACA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCACTCGCC---
tdbD5772|Streptococcus_pyogenes_SSI-1|193567|His|GTG                                GGCGGGTGTGGTGAAGT-GGTT-AACACATCAGATTGTGGCTCTGACA--TTCGTGGGTTCGATTCCCATCACTCGCC---
tdbD5777|Streptomyces_avermitilis_MA-4680|227882|His|GTG                            GGTGGGTGTAGCTCAGCTGGT--AGAGCACCTGGTTGTGGTCCAGGAT--GCCGCGGGTTCAAGTCCCGTCACTCACC---
tdbD5754|Streptomyces_coelicolor_A3(2)|100226|His|GTG                               GGTGGGTGTAGCTCAGCTGGT--AGAGCACCTGGTTGTGGTCCAGGAT--GCCGCGGGTTCAAGTCCCGTCACTCACC---
tdbD5802|Symbiobacterium_thermophilum_IAM_14863|292459|His|GTG                      GCTGACCGTAGCTCAGCTGGTT-AGAGCGCCAGATTGTGGCTCTGGAG--GTCGCCGGTTCGATTCCGGTCGGTCAGCCCA
tdbD5678|Synechocystis_sp._PCC_6803|1148|His|GTG                                    GGCGAGCGTAGCCAAGG-GGTT-AAGGCAGAGGATTGTGGTTCCTCCA--CTCGTGGGTTCGAATCCCATCGTTCGCC---
tdbD5742|Thermoanaerobacter_tengcongensis_MB4|273068|His|GTG                        GGTGGATATAGTTCAGGTGGCA-AGAACGCCAGATTGTGGCTCTGGAG--GTCGTGGGTTCAAGTCCCACTATCCACCCCA
tdbD5740|Thermosynechococcus_elongatus_BP-1|197221|His|GTG                          GGCGAGCGTAGCCAAGT-GGTT-AAGGCAGTGGATTGTGGTTCCACCA--TTCGTGGGTTCGAGTCCCATCGCTCGCC---
tdbD5679|Thermotoga_maritima_MSB8|243274|His|GTG                                    GGTGACCATAGCTCAGTTGGT--AGAGCGCCTGACTGTGGATCAGGTG--GTCGCGGGTTCGAGTCCCGCTGGTCACCCCA
tdbD5815|Thermus_thermophilus_HB27|262724|His|GTG                                   GGTGAGCGTAGCTCAGCTGGTT-AGAGCACCGGACTGTGGATCCGGGG--GTCGTGGGTTCAAGTCCCATCGCTCACCCCA
tdbD5816|Treponema_denticola_ATCC_35405|243275|His|GTG                              GGTGGGTATAGTTCAGG-GGT--AGAGCGCCAGATTGTGGTTCTGGTT--GTCGTGGGTTCAAATCCCACTACCCACC---
tdbD5676|Treponema_pallidum_subsp._pallidum_str._Nichols|243276|His|GTG             GGTGGGTGTAGTTCAGT-GGT--AGAGCGCCAGATTGTGGATCTGGTT--GTCGTGGGTTCGAATCCCATCACTCACC---
tdbD5766|Tropheryma_whipplei_str._Twist|203267|His|GTG                              GGTGGATATAGCTCAGCTGGT--AGAGCACCTGGTTGTGGTCCAGGAT--GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTTATCCACC---
tdbD5767|Tropheryma_whipplei_TW08/27|218496|His|GTG                                 GGTGGATATAGCTCAGCTGGT--AGAGCACCTGGTTGTGGTCCAGGAT--GTCGCGGGTTCGAGTCCCGTTATCCACC---
tdbD5661|Ureaplasma_parvum_serovar_3|38504|His|GTG                                  GGCGGTTATGGTGAAGTTGGTT-AACACGCCTGATTGTGGCTCAGGTATTTTCGCGGGTTCGAGTCCCGTTAATCGCCCCA
tdbD5657|Vibrio_cholerae_O1_biovar_El_Tor_str._N16961|243277|His|GTG                GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCCGGATTGTGATTCCGGTT--GTCGTGGGTTCGAGCCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5817|Wolbachia_endosymbiont_of_Drosophila_melanogaster|163164|His|GTG           GGCGGGCGTAGCTCAGTTGGT--AGAGCGTCAGTTTGTGGTACTGAAT--GTTGCCAGTTCGATCCTGGTCGCTCGCCCCA
tdbD5744|Xanthomonas_axonopodis_pv._citri_str._306|190486|His|GTG                   GGTGGCTGTAGCTCAGCTGGTT-AGAGTACTGGATTGTGATTCCAGAT--GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCCACCCCA
tdbD5743|Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913|190485|His|GTG       GGTGGCTGTAGCTCAGCTGGTT-AGAGTACTGGATTGTGATTCCAGAT--GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCCACCCCA
tdbD5680|Xylella_fastidiosa_9a5c|160492|His|GTG                                     GGTGGCTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGTACTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCCACCCCA
tdbD5768|Xylella_fastidiosa_Temecula1|183190|His|GTG                                GGTGGCTGTAGCTCAGTTGGTT-AGAGTACTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCAGCCACCCCA
tdbD5804|Yersinia_pestis_biovar_Microtus_str._91001|229193|His|GTG                  GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAGTCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5694|Yersinia_pestis_CO92|214092|His|GTG                                        GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAGTCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5746|Yersinia_pestis_KIM|187410|His|GTG                                         GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAGTCCCATTAGCCACCCCA
tdbD5805|Yersinia_pseudotuberculosis_IP_32953|273123|His|GTG                        GGTGGCTATAGCTCAGTTGGT--AGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTT--GTCGTGGGTTCGAGTCCCATTAGCCACCCCA
#=GC SS_cons                                                                        .(((((((..((((..........)))).(((((.......))))).......(((((.......))))))))))))....
#=GC SN                                                                             .0000000..1111..........1111.22222.......22222.......33333.......333330000000....

#=GF CS                                                                             81 columns, 21 paired, 19 covariant; 4 stems
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