Locus 737

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>dm3.chr2L 5230694 94 + 23011544
CCAAACCGAUCAACCCAGCAACAUGUUGUUGCUGCUGC--------UACCGAAGCAUU-UGCUACUGCAGCAGCAACAUGUUGCUUCUAGCCGUUUGAUUUUG----------
.(((((.(........((((((((((((((((((((((--------(.....))))..-.......))))))))))))))))))).....).)))))......---------- ( -37.82, z-score =  -5.87, R)
>droPer1.super_1 8469991 111 + 10282868
-CCAACCGAUCCACU-AUCAACAUGUUGCCCGUUCUAUUAUAUGCAUAUGCAUAUAGUACACGGAUAUAGUGGCAACAUGUUGCUGGCCGACUCUAGGCCCAGACUGCUCGAC
-.....(((......-..(((((((((((((((..((((((((((....)))))))))).)))........))))))))))))((((((.......)).)))).....))).. ( -39.00, z-score =  -4.16, R)
>dp4.chr4_group3 7017699 106 + 11692001
-CCAACCGAUCCACU-AUCAACAUGUUGCCCGUUCUAU-----GCAUAUGCAUAUAGUACACGGAUAUAGUGGCAGCAUGUUGCUGGCCGACUCUAGGCCCAGACUGCUCGAC
-.....(((......-..((((((((((((.((..(((-----((....)))))....))((.......))))))))))))))((((((.......)).)))).....))).. ( -32.50, z-score =  -1.63, R)
>droAna3.scaffold_12916 6247564 78 - 16180835
-UCAACCCACCAACGUGUUAGCAACAAGUUGC--------------------UGCAAC-CAC-AGUGCAGUAGCAACAUGUUGCCAGGCUCCUUCUGCCCU------------
-......(((....)))...((((((.(((((--------------------(((.((-...-.))...)))))))).))))))..(((.......)))..------------ ( -24.40, z-score =  -2.46, R)
>droEre2.scaffold_4929 5309548 94 + 26641161
CCAAAACGAACCGCC-AGCAACAUGUUGUUGCUGCUAC--------AAGCGAAGCAAU-UGCUACUGCAGCAGCAACAUGUUGCUCCUCGCCUUUUUGCUUUGG---------
(((((.((((..((.-(((((((((((((((((((...--------.(((((.....)-))))...)))))))))))))))))))....))...)))).)))))--------- ( -43.70, z-score =  -6.45, R)
>droYak2.chr2L 8356678 93 - 22324452
CCAAAUCGAUUCACC-AGCAACAUGUUGUUGCCGCUAC--------UACCGAAGCAAU-UGCUACUGCAGCAGCAACAUGUUGCUCCUUGCCGUUUGCUUUUG----------
.(((((.(.......-((((((((((((((((.(((..--------......)))...-(((....))))))))))))))))))).....).)))))......---------- ( -32.60, z-score =  -4.53, R)
>droSec1.super_5 3311446 81 + 5866729
CCAAACCGAUCCGUC-GCCAGCAACAUGUUGU--------------------UGCAAU-UGCUACUGCAGCAGCAACAUGUUGCUACUCGCCGUUUGCUUUUG----------
.((((((((....))-)..(((((((((((((--------------------(((...-(((....))))))))))))))))))).......)))))......---------- ( -32.30, z-score =  -4.93, R)
>droSim1.chr2L 5029190 81 + 22036055
CCAAACCGAACCGCC-AGCAACAUGUUGUUGC--------------------AGCAAU-UGCUACUGCAGCAGCAACAUGUUGCUACUCGCCGUUUGCUUUUG----------
.((((.(((((.((.-((((((((((((((((--------------------.(((..-......))).))))))))))))))))....)).)))))..))))---------- ( -35.10, z-score =  -5.33, R)
>consensus
CCAAACCGAUCCACC_AGCAACAUGUUGUUGCU_CUA_________UA___AAGCAAU_UGCUACUGCAGCAGCAACAUGUUGCUACUCGCCGUUUGCCUUUG__________
..................((((((((((((((.....................(((.........))).)))))))))))))).............................. (-14.67 = -14.20 +  -0.47) 

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>dm3.chr2L 5230694 94 - 23011544
----------CAAAAUCAAACGGCUAGAAGCAACAUGUUGCUGCUGCAGUAGCA-AAUGCUUCGGUA--------GCAGCAGCAACAACAUGUUGCUGGGUUGAUCGGUUUGG
----------..(((((...(((((...(((((((((((((((((((.(.(((.-...))).)....--------)))))))))...)))))))))).)))))...))))).. ( -40.90, z-score =  -4.83, R)
>droPer1.super_1 8469991 111 - 10282868
GUCGAGCAGUCUGGGCCUAGAGUCGGCCAGCAACAUGUUGCCACUAUAUCCGUGUACUAUAUGCAUAUGCAUAUAAUAGAACGGGCAACAUGUUGAU-AGUGGAUCGGUUGG-
..(((.(.((((.((((.......))))..((((((((((((........(((.((.(((((((....))))))).))..)))))))))))))))..-...)))).).))).- ( -40.30, z-score =  -2.51, R)
>dp4.chr4_group3 7017699 106 - 11692001
GUCGAGCAGUCUGGGCCUAGAGUCGGCCAGCAACAUGCUGCCACUAUAUCCGUGUACUAUAUGCAUAUGC-----AUAGAACGGGCAACAUGUUGAU-AGUGGAUCGGUUGG-
.(((((((((...((((.......))))....)).)))..(((((((.(((((......(((((....))-----)))..)))))(((....)))))-))))).))))....- ( -33.10, z-score =  -0.18, R)
>droAna3.scaffold_12916 6247564 78 + 16180835
------------AGGGCAGAAGGAGCCUGGCAACAUGUUGCUACUGCACU-GUG-GUUGCA--------------------GCAACUUGUUGCUAACACGUUGGUGGGUUGA-
------------.((((.......))))(((((((((((((.((..(...-)..-)).)))--------------------)))...)))))))..(((....)))......- ( -26.50, z-score =  -0.33, R)
>droEre2.scaffold_4929 5309548 94 - 26641161
---------CCAAAGCAAAAAGGCGAGGAGCAACAUGUUGCUGCUGCAGUAGCA-AUUGCUUCGCUU--------GUAGCAGCAACAACAUGUUGCU-GGCGGUUCGUUUUGG
---------(((((((.((...((.((.((((...((((((((((((((((((.-...)))..)).)--------))))))))))))...)))).))-.))..)).))))))) ( -42.20, z-score =  -3.84, R)
>droYak2.chr2L 8356678 93 + 22324452
----------CAAAAGCAAACGGCAAGGAGCAACAUGUUGCUGCUGCAGUAGCA-AUUGCUUCGGUA--------GUAGCGGCAACAACAUGUUGCU-GGUGAAUCGAUUUGG
----------......((((((.((...(((((((((((((((((((...(((.-...)))...)))--------)))))(....))))))))))))-..))...)).)))). ( -37.50, z-score =  -3.85, R)
>droSec1.super_5 3311446 81 - 5866729
----------CAAAAGCAAACGGCGAGUAGCAACAUGUUGCUGCUGCAGUAGCA-AUUGCA--------------------ACAACAUGUUGCUGGC-GACGGAUCGGUUUGG
----------((((......((.((..(((((((((((((.((((((....)))-...)))--------------------.))))))))))))).)-).))......)))). ( -31.10, z-score =  -2.76, R)
>droSim1.chr2L 5029190 81 - 22036055
----------CAAAAGCAAACGGCGAGUAGCAACAUGUUGCUGCUGCAGUAGCA-AUUGCU--------------------GCAACAACAUGUUGCU-GGCGGUUCGGUUUGG
----------((((..(.(((.((...(((((((((((((.(((.(((((....-))))).--------------------))).))))))))))))-))).))).).)))). ( -35.30, z-score =  -3.39, R)
>consensus
__________CAAAAGCAAAAGGCGAGUAGCAACAUGUUGCUGCUGCAGUAGCA_AUUGCAU___UA_________UAG_AGCAACAACAUGUUGCU_GGUGGAUCGGUUUGG
.....................(((((...((((....))))(((.......)))......................................)))))................ ( -5.60 =  -4.92 +  -0.67) 

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