Locus 4080

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>dm3.chr2R 10248056 104 + 21146708
-AUCAGCAAAUAUAUGGUUACAAUAGC---GAUGAUUGC--CAUGUCUCUCAACACAGUGAUCA----UAUCUUUUGAUAGCCAAAUAAUCGCUUUUUCUCCGCUG-ACCGGCAC
-...(((...(((.(((((((((.((.---.(((((..(--..(((......)))..)..))))----)..)).))).)))))).)))...)))........(((.-...))).. ( -24.40, z-score =  -1.98, R)
>droPer1.super_2 4614440 99 + 9036312
--GCAACGCAAACA--ACGGCUAAAAC---GGUGACCACUGCAGUGUGGUGAAUACAUUGGUCA----CCA--UUUG--CGCCACGUAUACGUUACAUCUUCGCUG-ACAGGCAC
--((((.((.....--...))......---((((((((.....(((((.....)))))))))))----)).--.)))--)(((..(((.....))).((......)-)..))).. ( -27.30, z-score =  -0.41, R)
>dp4.chr3 4426673 99 + 19779522
--GCAACGCAAACA--ACGGCUAAAAC---GGUGACCACUGCAGUGUGGUGAAUACAUUGGUCA----CCA--UUUG--CGCCACGUAUACGUUACAUCUUCGCUG-ACAGGCAC
--((((.((.....--...))......---((((((((.....(((((.....)))))))))))----)).--.)))--)(((..(((.....))).((......)-)..))).. ( -27.30, z-score =  -0.41, R)
>droAna3.scaffold_13266 14593597 110 + 19884421
AUUCAACGAAAGCAUUACGGCAAGGAACAGGAUGAUCUCGGCAUUUGUUAGAAUGCAAAAAUCA----UCAAAUUCGGUUGCCAUUUAAUCGUUGACCUUCCGCUG-AACGGCAC
..(((((((..(.....)(((((.(((...((((((....((((((....))))))....))))----))...)))..)))))......)))))))......(((.-...))).. ( -30.70, z-score =  -2.33, R)
>droEre2.scaffold_4845 6994258 102 - 22589142
-AUCA-CAAAUA-AUGGAUACAAAAGC---UAUGAUUGC--CAUGUCUUUCAACACAGCAAUCA----UCUCUCUUGACAGCCAACUAAUCGCUGCUCCUCCGCUG-ACCGGCAC
-....-......-..(((..(((.((.---.((((((((--..(((......)))..)))))))----)..)).))).((((.........))))....)))(((.-...))).. ( -23.00, z-score =  -2.64, R)
>droYak2.chr2R 10183932 103 + 21139217
-AUGAGCAAAAA-AUUGGUACAAAAGC---GAUGAUUGC--CAUGUUUCUCAACACAGCGAUCA----UCUCUCUUGGUAGCCAACUAAUCGCUGCUCCUCCGCCG-ACCGGCAC
-..(((((....-.(((((.(((.((.---(((((((((--..((((....))))..)))))))----)).)).)))...)))))........)))))....(((.-...))).. ( -33.32, z-score =  -3.95, R)
>droSec1.super_1 7754230 104 + 14215200
-AUCAGCAAAUAAAUCGUUACAAAAGC---GAUGAUUGC--CAUGUCUCUCAACAGAGCGAUCA----UCUCUUUUGUUAGCCAGCUAAUCGCUUUUUCUCCGCUG-ACCGGCAC
-.(((((.........((((((((((.---(((((((((--..(((......)))..)))))))----)).)))))).)))).(((.....)))........))))-)....... ( -33.30, z-score =  -4.55, R)
>droVir3.scaffold_12875 13551853 111 + 20611582
--GCAAUUCGAACUUGGCGACAAGCGG--ACGCGAGCCCUGCUGGCCGAAGCCUGCAGAGCUUUACGCCUACGCCUGAUCGCCUUGUGCGCACUGCAGCAGCGCUGCGCCGGCAC
--((.......((..(((((((.(((.--..((((((.((((.(((....))).)))).)))...)))...))).)).)))))..))(((((.(((....))).)))))..)).. ( -48.80, z-score =  -1.57, R)
>consensus
_AUCAACAAAAACAUGGCGACAAAAGC___GAUGAUCGC__CAUGUCUCUCAACACAGCGAUCA____UCACUUUUGAUAGCCAACUAAUCGCUGCUUCUCCGCUG_ACCGGCAC
.................................(((((....................))))).......................................(((.....))).. ( -6.58 =  -5.35 +  -1.23) 

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Window 6

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>dm3.chr2R 10248056 104 - 21146708
GUGCCGGU-CAGCGGAGAAAAAGCGAUUAUUUGGCUAUCAAAAGAUA----UGAUCACUGUGUUGAGAGACAUG--GCAAUCAUC---GCUAUUGUAACCAUAUAUUUGCUGAU-
...(((..-...)))......(((((.(((.(((.((.(((.((..(----((((..(((((((....))))))--)..))))).---.)).))))).))).))).)))))...- ( -29.00, z-score =  -1.76, R)
>droPer1.super_2 4614440 99 - 9036312
GUGCCUGU-CAGCGAAGAUGUAACGUAUACGUGGCG--CAAA--UGG----UGACCAAUGUAUUCACCACACUGCAGUGGUCACC---GUUUUAGCCGU--UGUUUGCGUUGC--
.(((....-..))).....((((((((.(((((((.--.(((--(((----((((((.((((..........)))).))))))))---))))..)))).--))).))))))))-- ( -36.40, z-score =  -2.16, R)
>dp4.chr3 4426673 99 - 19779522
GUGCCUGU-CAGCGAAGAUGUAACGUAUACGUGGCG--CAAA--UGG----UGACCAAUGUAUUCACCACACUGCAGUGGUCACC---GUUUUAGCCGU--UGUUUGCGUUGC--
.(((....-..))).....((((((((.(((((((.--.(((--(((----((((((.((((..........)))).))))))))---))))..)))).--))).))))))))-- ( -36.40, z-score =  -2.16, R)
>droAna3.scaffold_13266 14593597 110 - 19884421
GUGCCGUU-CAGCGGAAGGUCAACGAUUAAAUGGCAACCGAAUUUGA----UGAUUUUUGCAUUCUAACAAAUGCCGAGAUCAUCCUGUUCCUUGCCGUAAUGCUUUCGUUGAAU
.....(((-((((((((((((...)))...(((((((..((((..((----(((((((.(((((......))))).)))))))))..)))).)))))))....)))))))))))) ( -39.60, z-score =  -4.80, R)
>droEre2.scaffold_4845 6994258 102 + 22589142
GUGCCGGU-CAGCGGAGGAGCAGCGAUUAGUUGGCUGUCAAGAGAGA----UGAUUGCUGUGUUGAAAGACAUG--GCAAUCAUA---GCUUUUGUAUCCAU-UAUUUG-UGAU-
...(((..-...))).((((((((.(.....).)))))((((((..(----(((((((((((((....))))))--)))))))).---.))))))..)))..-......-....- ( -40.00, z-score =  -4.48, R)
>droYak2.chr2R 10183932 103 - 21139217
GUGCCGGU-CGGCGGAGGAGCAGCGAUUAGUUGGCUACCAAGAGAGA----UGAUCGCUGUGUUGAGAAACAUG--GCAAUCAUC---GCUUUUGUACCAAU-UUUUUGCUCAU-
.((((...-.)))).....(.(((((..((((((.(((.(((((.((----((((.((((((((....))))))--)).))))))---.)))))))))))))-)..))))))..- ( -42.00, z-score =  -4.09, R)
>droSec1.super_1 7754230 104 - 14215200
GUGCCGGU-CAGCGGAGAAAAAGCGAUUAGCUGGCUAACAAAAGAGA----UGAUCGCUCUGUUGAGAGACAUG--GCAAUCAUC---GCUUUUGUAACGAUUUAUUUGCUGAU-
......((-(((((((.(((.(((.....))).....(((((((.((----((((.(((.((((....)))).)--)).))))))---.))))))).....))).)))))))))- ( -38.00, z-score =  -3.79, R)
>droVir3.scaffold_12875 13551853 111 - 20611582
GUGCCGGCGCAGCGCUGCUGCAGUGCGCACAAGGCGAUCAGGCGUAGGCGUAAAGCUCUGCAGGCUUCGGCCAGCAGGGCUCGCGU--CCGCUUGUCGCCAAGUUCGAAUUGC--
((((((..(((((...)))))..)).))))..(((((.((((((..(((((..((((((((.(((....))).)))))))).))))--)))))))))))).............-- ( -60.10, z-score =  -3.06, R)
>consensus
GUGCCGGU_CAGCGGAGAAGCAGCGAUUACUUGGCUAUCAAAAGAGA____UGAUCACUGUAUUCAGAGACAUG__GCAAUCAUC___GCUUUUGUAGCCAUGUUUUUGUUGAU_
.(((.......))).......(((((............(((((........(((((((..................))))))).......)))))...........))))).... ( -7.70 =  -6.73 +  -0.97) 

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