Locus 8622

Sequence ID X_DroMel_CAF1
Location 21,666,015 – 21,666,123
Length 108
Max. P 0.500000
window14174

overview

Window 4

Location 21,666,015 – 21,666,123
Length 108
Sequences 6
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 80.26
Mean single sequence MFE -38.92
Consensus MFE -24.63
Energy contribution -26.30
Covariance contribution 1.67
Combinations/Pair 1.26
Mean z-score -1.39
Structure conservation index 0.63
SVM decision value -0.06
SVM RNA-class probability 0.500000
Prediction OTHER

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>X_DroMel_CAF1 21666015 108 - 22224390
AAUGCCCCGACCUGGAACGUGAC---AGUUCACAGUUGGGUUUAUAGUUGGCCGGACUGUACUUUUCAUAAAUGUCCAGUCCGGAGGUGG---------CCACCAAACGGGCCAGCGAUG
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>DroVir_CAF1 8598 108 - 1
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>DroPse_CAF1 10672 111 - 1
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>DroWil_CAF1 7440 117 - 1
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>DroAna_CAF1 6600 108 - 1
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>DroPer_CAF1 10311 111 - 1
UGAGCCCCGAUCUAGAACGUGACGAUGGUUCACUGUUGGGUUUAUAGUUGGCCGGACUGUACUUUUCGUACAUGUCCAGCCCCGAGGUGG---------CCACUAAACGUGCUAGGGAUG
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>consensus
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