Locus 8316

Sequence ID X_DroMel_CAF1
Location 20,664,820 – 20,664,940
Length 120
Max. P 0.846801
window13658

overview

Window 8

Location 20,664,820 – 20,664,940
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction forward
Mean pairwise identity 99.17
Mean single sequence MFE -29.18
Consensus MFE -28.34
Energy contribution -28.74
Covariance contribution 0.40
Combinations/Pair 1.00
Mean z-score -1.43
Structure conservation index 0.97
SVM decision value 0.77
SVM RNA-class probability 0.846801
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>X_DroMel_CAF1 20664820 120 + 22224390
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>DroSec_CAF1 66463 120 + 1
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>DroSim_CAF1 43926 120 + 1
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>DroEre_CAF1 62136 120 + 1
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>DroYak_CAF1 63455 120 + 1
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>consensus
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