Locus 6220

Sequence ID X_DroMel_CAF1
Location 15,819,822 – 15,819,942
Length 120
Max. P 0.947454
window10129

overview

Window 9

Location 15,819,822 – 15,819,942
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 97.33
Mean single sequence MFE -25.40
Consensus MFE -23.66
Energy contribution -24.46
Covariance contribution 0.80
Combinations/Pair 1.00
Mean z-score -1.55
Structure conservation index 0.93
SVM decision value 1.37
SVM RNA-class probability 0.947454
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>X_DroMel_CAF1 15819822 120 - 22224390
CGAUCGGAACUUAUAUUUAAAAUGUGAAACAUCAAACGACAUACGAUUUUGCGAACAGAAAUCAUAUUAAAUAUCGUUCUGUUAACGUUCAGUUGUUGUAUACAUUGUUUGUUGGAUCAC
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>DroSec_CAF1 2861 120 - 1
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>DroSim_CAF1 2966 120 - 1
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>DroEre_CAF1 1660 120 - 1
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>DroYak_CAF1 1654 120 - 1
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>consensus
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