Locus 6086

Sequence ID X_DroMel_CAF1
Location 15,615,381 – 15,615,501
Length 120
Max. P 0.848218
window9886

overview

Window 6

Location 15,615,381 – 15,615,501
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 95.50
Mean single sequence MFE -38.90
Consensus MFE -36.06
Energy contribution -35.30
Covariance contribution -0.76
Combinations/Pair 1.13
Mean z-score -1.30
Structure conservation index 0.93
SVM decision value 0.78
SVM RNA-class probability 0.848218
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>X_DroMel_CAF1 15615381 120 - 22224390
CAAAAUGCUCUCGACCAUCAAGGCGAAUUGCGAGCGAAUCUUUGUGAUUAGCUACUAUCUAUGCGAUGAUACGCUGCAAAUCCAGGAGAUCGCCGUGCGGAACUCCGGAUUCCUCGGUGG
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>DroSec_CAF1 3782 120 - 1
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>DroSim_CAF1 3766 120 - 1
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>DroEre_CAF1 3881 120 - 1
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>DroYak_CAF1 3802 120 - 1
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>consensus
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alignment

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secondary structure

Postscript

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