Locus 9868

Sequence ID 3R_DroMel_CAF1
Location 26,313,227 – 26,313,347
Length 120
Max. P 0.984746
window15747

overview

Window 7

Location 26,313,227 – 26,313,347
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction forward
Mean pairwise identity 92.83
Mean single sequence MFE -50.94
Consensus MFE -46.10
Energy contribution -46.94
Covariance contribution 0.84
Combinations/Pair 1.07
Mean z-score -1.71
Structure conservation index 0.90
SVM decision value 1.98
SVM RNA-class probability 0.984746
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3R_DroMel_CAF1 26313227 120 + 27905053
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>DroSim_CAF1 38590 120 + 1
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>DroEre_CAF1 43266 120 + 1
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>DroYak_CAF1 38854 120 + 1
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>DroAna_CAF1 41338 120 + 1
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>consensus
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