Locus 9660

Sequence ID 3R_DroMel_CAF1
Location 25,547,493 – 25,547,604
Length 111
Max. P 0.500000
window15439

overview

Window 9

Location 25,547,493 – 25,547,604
Length 111
Sequences 6
Columns 114
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 82.08
Mean single sequence MFE -47.47
Consensus MFE -31.15
Energy contribution -32.57
Covariance contribution 1.42
Combinations/Pair 1.30
Mean z-score -1.49
Structure conservation index 0.66
SVM decision value -0.07
SVM RNA-class probability 0.500000
Prediction OTHER

Download alignment: ClustalW | MAF

>3R_DroMel_CAF1 25547493 111 - 27905053
CGGUGGCAGGUGCAUGGGUUGGCCUCUGAACUGGGAGGGCAGUGGUAUCAGCACGGGCGGCAAUCCCUGCUGAUUCAACGGCACUGGCAUCUGCUCCUUGGGCA---UCUCCUG
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>DroVir_CAF1 40598 114 - 1
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>DroSec_CAF1 31103 111 - 1
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>DroEre_CAF1 31879 111 - 1
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>DroYak_CAF1 34212 111 - 1
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>DroAna_CAF1 42000 111 - 1
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>consensus
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alignment

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