Locus 9408

Sequence ID	3R_DroMel_CAF1
Location	24,924,540 – 24,924,660
Length	120
Max. P	0.805162

overview

Window 2

Location	24,924,540 – 24,924,660
Length	120
Sequences	6
Columns	120
Reading direction	reverse
Mean pairwise identity	79.29
Mean single sequence MFE	-55.80
Consensus MFE	-33.85
Energy contribution	-35.13
Covariance contribution	1.29
Combinations/Pair	1.38
Mean z-score	-1.91
Structure conservation index	0.61
SVM decision value	0.63
SVM RNA-class probability	0.805162
Prediction	RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3R_DroMel_CAF1 24924540 120 - 27905053
UAUCCGCAGCAGUUGUUGCUGUGCCGGCUGCGUCUGCAGUUGGGGUUGCCCGCGGGCAUUCUGCUGGAUGACGAGGGACGGUGUGGUCGUCAGCUGAGGCGUAGGUGGUCGCAGAAUUAG
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>DroVir_CAF1 50795 111 - 1
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>DroPse_CAF1 1463 117 - 1
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>DroMoj_CAF1 43451 114 - 1
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>DroAna_CAF1 1512 120 - 1
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>DroPer_CAF1 1454 117 - 1
AAUGCGCAGCAGCUGCUGCUGGGCCGGCUGCGA---CAGUUGCGGCUGACCGCGUCCAUUCUGCUGGAUGACCAGCGAGGGCGCCGCCGUAAGCUGCGGCGUGGGCGGGCGCAGGAUCAG
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>consensus
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