Locus 8850

Sequence ID 3R_DroMel_CAF1
Location 23,744,393 – 23,744,507
Length 114
Max. P 0.527773
window14208

overview

Window 8

Location 23,744,393 – 23,744,507
Length 114
Sequences 6
Columns 114
Reading direction forward
Mean pairwise identity 79.77
Mean single sequence MFE -44.05
Consensus MFE -24.10
Energy contribution -24.63
Covariance contribution 0.53
Combinations/Pair 1.34
Mean z-score -1.82
Structure conservation index 0.55
SVM decision value -0.01
SVM RNA-class probability 0.527773
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3R_DroMel_CAF1 23744393 114 + 27905053
UUUCUGGUGGUCCAGACGCUGACCACAGCGAAAGCACAGAGCACCAGGUCCAUAGUGCGCGGUCAUGUGGCUCUGGUGCUCCAGCAAGGUUUUGGCCACAUCGCCGCACACCGC
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>DroVir_CAF1 270223 114 + 1
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>DroSec_CAF1 194071 114 + 1
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>DroSim_CAF1 193010 114 + 1
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>DroEre_CAF1 203981 114 + 1
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>DroYak_CAF1 201110 114 + 1
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>consensus
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alignment

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