Locus 8458

Sequence ID 3R_DroMel_CAF1
Location 22,563,593 – 22,563,688
Length 95
Max. P 0.744802
window13610

overview

Window 0

Location 22,563,593 – 22,563,688
Length 95
Sequences 6
Columns 107
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 79.53
Mean single sequence MFE -40.53
Consensus MFE -24.13
Energy contribution -25.06
Covariance contribution 0.93
Combinations/Pair 1.33
Mean z-score -1.87
Structure conservation index 0.60
SVM decision value 0.46
SVM RNA-class probability 0.744802
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3R_DroMel_CAF1 22563593 95 - 27905053
CAUGUUGCAUUCGUGGU---UGUGUCAGGGUCGGUG---GUGGC---UGCCACACCCUGCUGCAG---CAGCUGCAGCAUGGUCAGGAUCAGGAUCAGGAGCAGAAU
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>DroPse_CAF1 12933 98 - 1
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>DroSec_CAF1 11736 95 - 1
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>DroSim_CAF1 13420 95 - 1
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>DroEre_CAF1 11668 95 - 1
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>DroYak_CAF1 12082 101 - 1
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>consensus
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