Locus 7244

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>3R_DroMel_CAF1 19091871 105 + 27905053
GUUGCGAGUCAAGGGCUUGUGAUUUUUGACGAUGUCACAGCUGUGCUGCCAUUGCCAGCAGCUGCGGCAGAAGUAUCUGUAAACAGAAUGUAGGA---A-AUAAAAUAU-
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>DroVir_CAF1 7922 103 + 1
GUUACGUGUCAAUGGCUUGUGAUUUUUAAUAAUUUCACAGCUGUGUUGCCAUUGCCAACAGCUGCGGCAAAAGUAACUGCAAC-AGA-UACAUGU---A-AUUUAGU-UA
(((((((((...(((((.((((..((....))..)))))))((((((((..(((((.........)))))..))))).))).)-)..-.))))))---)-)).....-.. ( -28.80)
>DroGri_CAF1 7614 104 + 1
GCUACGUGUCAAGGGCUUGUGAUUUUUAAUAAUUUCACAGCUGUGCUGCCAUUGCCAACAGCUGCGGCAAAAGUAACUGCAAC-ACAAUUAGUUU---C-AAUUAGU-UG
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>DroEre_CAF1 7850 106 + 1
GUUGCGCGUCAAGGGCUUGUGAUUUUUGACGAUGUCGCAGCUGUGCUGCCAUUGCCAGCAGCUGCGGCAGAAGUAUCUGCAAAUGGAAUAUAUGA---AAGUAAAGUAU-
.((((.((((((((((....).))))))))).((((((((((((...((....))..)))))))))))).........))))........(((..---..)))......- ( -36.00)
>DroMoj_CAF1 7612 103 + 1
AUUUCUUGUCAAAGGCUUGUGAUUUUUGAUAAUUUCACAGCUGUGCUGCCAUUGCCAACAGCUGCGGCAAAAGUAACUGCAAU-GGA-UAUGCAU---A-GGUAAAUAU-
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>DroAna_CAF1 7509 106 + 1
GUUACGGGUCAAGGGUUUGUGAUUCUUGACGAUGUCACAGCUAUGCUGCCAUUGCCAGCAGCUGCGACAGAAGUAUCUGGAA-UAGAA-GUAGCUUUCC-UUUAAAUAU-
(((((..((((((((((...))))))))))..((((.(((((..((((.......))))))))).)))).............-.....-))))).....-.........- ( -31.50)
>consensus
GUUACGUGUCAAGGGCUUGUGAUUUUUGACAAUGUCACAGCUGUGCUGCCAUUGCCAACAGCUGCGGCAAAAGUAACUGCAAA_AGAAUAUAUGU___A_AUUAAAUAU_
..(((........((((.((((..((....))..)))))))).((((((..(((....)))..))))))...)))................................... (-16.64 = -16.33 +  -0.30) 

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>3R_DroMel_CAF1 19091871 105 - 27905053
-AUAUUUUAU-U---UCCUACAUUCUGUUUACAGAUACUUCUGCCGCAGCUGCUGGCAAUGGCAGCACAGCUGUGACAUCGUCAAAAAUCACAAGCCCUUGACUCGCAAC
-.........-.---........((((....))))......((((((((((((((.(...).))))..))))))).....(((((.............)))))..))).. ( -24.12)
>DroVir_CAF1 7922 103 - 1
UA-ACUAAAU-U---ACAUGUA-UCU-GUUGCAGUUACUUUUGCCGCAGCUGUUGGCAAUGGCAACACAGCUGUGAAAUUAUUAAAAAUCACAAGCCAUUGACACGUAAC
..-......(-(---((.(((.-...-(((((((......))))(((((((((..((....))...)))))))))..................))).....))).)))). ( -23.60)
>DroGri_CAF1 7614 104 - 1
CA-ACUAAUU-G---AAACUAAUUGU-GUUGCAGUUACUUUUGCCGCAGCUGUUGGCAAUGGCAGCACAGCUGUGAAAUUAUUAAAAAUCACAAGCCCUUGACACGUAGC
..-.......-.---...(((...((-(((((((......))))(((((((((..((....))...))))))))).........................))))).))). ( -24.80)
>DroEre_CAF1 7850 106 - 1
-AUACUUUACUU---UCAUAUAUUCCAUUUGCAGAUACUUCUGCCGCAGCUGCUGGCAAUGGCAGCACAGCUGCGACAUCGUCAAAAAUCACAAGCCCUUGACGCGCAAC
-...........---...............(((((....)))))(((((((((((.(...).))))..)))))))....((((((.............))))))...... ( -28.12)
>DroMoj_CAF1 7612 103 - 1
-AUAUUUACC-U---AUGCAUA-UCC-AUUGCAGUUACUUUUGCCGCAGCUGUUGGCAAUGGCAGCACAGCUGUGAAAUUAUCAAAAAUCACAAGCCUUUGACAAGAAAU
-.........-.---.((((..-...-..)))).....(((((.(((((((((..((....))...)))))))))......(((((...........))))))))))... ( -22.10)
>DroAna_CAF1 7509 106 - 1
-AUAUUUAAA-GGAAAGCUAC-UUCUA-UUCCAGAUACUUCUGUCGCAGCUGCUGGCAAUGGCAGCAUAGCUGUGACAUCGUCAAGAAUCACAAACCCUUGACCCGUAAC
-.........-((((((....-..)).-))))...(((...((((((((((((((.(...).))))..))))))))))..((((((...........))))))..))).. ( -30.70)
>consensus
_AUACUUAAU_U___ACAUAUAUUCU_GUUGCAGAUACUUCUGCCGCAGCUGCUGGCAAUGGCAGCACAGCUGUGAAAUCAUCAAAAAUCACAAGCCCUUGACACGUAAC
..............................((((......))))(((((((((((.(...).))))..)))))))................................... (-17.51 = -17.07 +  -0.44) 

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