Locus 6198

Sequence ID 3R_DroMel_CAF1
Location 16,191,181 – 16,191,301
Length 120
Max. P 0.781127
window10104

overview

Window 4

Location 16,191,181 – 16,191,301
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction forward
Mean pairwise identity 93.08
Mean single sequence MFE -41.04
Consensus MFE -34.52
Energy contribution -36.28
Covariance contribution 1.76
Combinations/Pair 1.03
Mean z-score -1.46
Structure conservation index 0.84
SVM decision value 0.56
SVM RNA-class probability 0.781127
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3R_DroMel_CAF1 16191181 120 + 27905053
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>DroSec_CAF1 20457 120 + 1
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>DroSim_CAF1 13980 120 + 1
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>DroEre_CAF1 19759 119 + 1
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>DroYak_CAF1 21133 115 + 1
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>consensus
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alignment

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secondary structure

Postscript

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