Locus 2232

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>3R_DroMel_CAF1 6357130 99 + 27905053
--GGGCGCAAUUAAUUUGCAGACAGCGAA--------UCAGCCUUGAGGCUUU-A-AGCAGUUGACAAUUGUCAAGGACUG-CGACAAC----UUGGCGGCUGAACGCAAAGUUGU
--.(((((((.....)))).....(((..--------(((((((..((.....-.-.(((((((((....))))...))))-).....)----)..).)))))).)))...))).. ( -32.90)
>DroVir_CAF1 130823 103 + 1
--GGGCGCAAUUAAUUUGCAGACGGCGAAGCUGAAGCUCAGCCUUGAGGCUGC-C-AGCAGUUGACAAUUGUCAAGGACUG-CGUCAAC----UUGGCGGCG--ACUCACAGUU--
--((((((((.....))))...((((...))))..))))(((..(((((((((-(-(..(((((((....(((...)))..-.))))))----)))))))).--.))))..)))-- ( -38.50)
>DroGri_CAF1 156795 107 + 1
--GGACGCAAUUAAUUUGCAGACAGCGAUGUUGAAGCUCAGCCUUGAGGCUGC-C-AAGCGUUGACAAUUGUCAAGGACUG-CGUCUGCCACACUGGCGGCG--ACUCACAGUU--
--....((((.....)))).(((((...(((..(.((((((((....))))).-.-.))).)..))).)))))...(((((-((.(((((.....)))))))--.....)))))-- ( -35.90)
>DroWil_CAF1 213914 97 + 1
GGGAGCACAAUUAAUUUGCAGACGGCAAA--------GCAGCCUUGAGGCUGCCA-AAUGGUUGACAAUUGUCAAGGACUG-CGCCAAG----UUGGCGGCUUA-----AAGUCGU
..((((...........((((........--------((((((....))))))..-.....(((((....)))))...)))-)(((...----..))).)))).-----....... ( -31.40)
>DroAna_CAF1 123244 98 + 1
--GGGCGCAAUUAAUUUGCAGACGGCGAA--------UCAGCCUUGAGGCUUU-AAAACAGUUGACAAUUGUCAAGGACCGCCGACAAC----UUGGCGGCAGAAGUCU---UGGC
--....((((.....))))....(((...--------...)))(..(((((((-.......(((((....))))).(.(((((((....----)))))))).)))))))---..). ( -33.50)
>DroPer_CAF1 127069 99 + 1
--GGGCGCAAUUAAUUUGCAGACAGCGAA--------GCAGCCUUGAGGCUGC-C-AACAGUUGACAAUUGUCAAGGACUG-CGACAAC----UUGGCGGCAAGAGUCAACGUUGU
--....((((.....))))..(((((...--------((((((....))))))-.-....((((((..(((((........-.)))))(----(((....)))).))))))))))) ( -34.50)
>consensus
__GGGCGCAAUUAAUUUGCAGACAGCGAA________UCAGCCUUGAGGCUGC_A_AACAGUUGACAAUUGUCAAGGACUG_CGACAAC____UUGGCGGCA_AACUCAAAGUUGU
...(.(((.......(((..(.((((............(((((....))))).........(((((....))))).).))).)..)))........))).)............... (-16.74 = -17.04 +   0.31) 

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>3R_DroMel_CAF1 6357130 99 - 27905053
ACAACUUUGCGUUCAGCCGCCAA----GUUGUCG-CAGUCCUUGACAAUUGUCAACUGCU-U-AAAGCCUCAAGGCUGA--------UUCGCUGUCUGCAAAUUAAUUGCGCCC--
........(((.((((((.....----(((...(-((((...((((....))))))))).-.-..))).....))))))--------..))).....((((.....))))....-- ( -29.00)
>DroVir_CAF1 130823 103 - 1
--AACUGUGAGU--CGCCGCCAA----GUUGACG-CAGUCCUUGACAAUUGUCAACUGCU-G-GCAGCCUCAAGGCUGAGCUUCAGCUUCGCCGUCUGCAAAUUAAUUGCGCCC--
--.....((((.--.((.(((((----(((((((-..(((...)))...))))))))..)-)-)).)))))).(((.((((....)))).)))....((((.....))))....-- ( -34.70)
>DroGri_CAF1 156795 107 - 1
--AACUGUGAGU--CGCCGCCAGUGUGGCAGACG-CAGUCCUUGACAAUUGUCAACGCUU-G-GCAGCCUCAAGGCUGAGCUUCAACAUCGCUGUCUGCAAAUUAAUUGCGUCC--
--..........--.(((((....))))).((((-((((..(((((....))))).((..-(-(((((((((....))))..........)))))).))......)))))))).-- ( -34.90)
>DroWil_CAF1 213914 97 - 1
ACGACUU-----UAAGCCGCCAA----CUUGGCG-CAGUCCUUGACAAUUGUCAACCAUU-UGGCAGCCUCAAGGCUGC--------UUUGCCGUCUGCAAAUUAAUUGUGCUCCC
.......-----..(((((((..----...)))(-(((.(.(((((....))))).((..-.(((((((....))))))--------).))..).)))).........).)))... ( -30.20)
>DroAna_CAF1 123244 98 - 1
GCCA---AGACUUCUGCCGCCAA----GUUGUCGGCGGUCCUUGACAAUUGUCAACUGUUUU-AAAGCCUCAAGGCUGA--------UUCGCCGUCUGCAAAUUAAUUGCGCCC--
((..---((((....((((((..----......))))))..(((((....))))).......-..((((....))))..--------......))))((((.....))))))..-- ( -27.10)
>DroPer_CAF1 127069 99 - 1
ACAACGUUGACUCUUGCCGCCAA----GUUGUCG-CAGUCCUUGACAAUUGUCAACUGUU-G-GCAGCCUCAAGGCUGC--------UUCGCUGUCUGCAAAUUAAUUGCGCCC--
.((((((((((.((((....)))----)((((((-.......))))))..)))))).)))-)-((((((....))))))--------..........((((.....))))....-- ( -30.90)
>consensus
ACAACUUUGAGUU_AGCCGCCAA____GUUGUCG_CAGUCCUUGACAAUUGUCAACUGUU_G_GCAGCCUCAAGGCUGA________UUCGCCGUCUGCAAAUUAAUUGCGCCC__
..................(((((.....(((..(.((((..(((((....))))).........(((((....)))))............)))).)..))).....))).)).... (-16.41 = -16.97 +   0.56) 

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