Locus 2117

Sequence ID 3R_DroMel_CAF1
Location 6,043,872 – 6,043,977
Length 105
Max. P 0.863243
window3459

overview

Window 9

Location 6,043,872 – 6,043,977
Length 105
Sequences 6
Columns 109
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 76.29
Mean single sequence MFE -45.19
Consensus MFE -29.42
Energy contribution -29.92
Covariance contribution 0.49
Combinations/Pair 1.32
Mean z-score -1.57
Structure conservation index 0.65
SVM decision value 0.84
SVM RNA-class probability 0.863243
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3R_DroMel_CAF1 6043872 105 - 27905053
--AU--UGGCAUUGCUGCCCACCGCCGUGACAUUGGUGGGCGGCGGUGGUGGUGGACCCGCCGGUGGGGGCGGGGAUUGGAUGGCAUUGCCAUUGCGAUUGAUGCGCGA
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>DroVir_CAF1 54108 95 - 1
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>DroPse_CAF1 48554 105 - 1
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>DroEre_CAF1 50384 105 - 1
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>DroWil_CAF1 56431 93 - 1
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>DroPer_CAF1 48757 105 - 1
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>consensus
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alignment

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