Locus 10300

Sequence ID 3R_DroMel_CAF1
Location 27,615,894 – 27,615,998
Length 104
Max. P 0.794795
window16399

overview

Window 9

Location 27,615,894 – 27,615,998
Length 104
Sequences 6
Columns 104
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 93.50
Mean single sequence MFE -21.27
Consensus MFE -17.38
Energy contribution -17.22
Covariance contribution -0.17
Combinations/Pair 1.06
Mean z-score -2.38
Structure conservation index 0.82
SVM decision value 0.60
SVM RNA-class probability 0.794795
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3R_DroMel_CAF1 27615894 104 - 27905053
AUCAUUUAUAUACUAUAUAAAUACAAUUAUAUGGUACUGUAAACGUGCAACUUAACGCUUCUUAUAGAUUAUGAGUGUGUUUCUUUCUGCCUACGUCCGUUUCU
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>DroSec_CAF1 17711 104 - 1
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>DroSim_CAF1 17777 104 - 1
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>DroEre_CAF1 17887 102 - 1
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>DroYak_CAF1 17825 102 - 1
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>DroAna_CAF1 18042 98 - 1
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>consensus
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alignment

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