Locus 10054

Sequence ID 3R_DroMel_CAF1
Location 26,945,701 – 26,945,820
Length 119
Max. P 0.993748
window16013

overview

Window 3

Location 26,945,701 – 26,945,820
Length 119
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 92.22
Mean single sequence MFE -47.98
Consensus MFE -39.12
Energy contribution -39.56
Covariance contribution 0.44
Combinations/Pair 1.12
Mean z-score -2.57
Structure conservation index 0.82
SVM decision value 2.42
SVM RNA-class probability 0.993748
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3R_DroMel_CAF1 26945701 119 - 27905053
UUCGUCCUUCUUUGUGUCCAGCUAGUCUCUCCUUGGGACUACGUGGCUAACGUGAGUAA-CGCAUCGUUGCGUAUACGCAACGUAAACCCUGGCAGGCGGGGCAUAGCAGCAACAGGAUC
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>DroSec_CAF1 13360 117 - 1
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>DroSim_CAF1 13397 118 - 1
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>DroEre_CAF1 15959 116 - 1
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>DroYak_CAF1 13840 117 - 1
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>consensus
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