Locus 8399

Sequence ID 3L_DroMel_CAF1
Location 22,081,767 – 22,081,874
Length 107
Max. P 0.713127
window13735

overview

Window 5

Location 22,081,767 – 22,081,874
Length 107
Sequences 5
Columns 113
Reading direction forward
Mean pairwise identity 90.65
Mean single sequence MFE -37.56
Consensus MFE -28.63
Energy contribution -28.58
Covariance contribution -0.05
Combinations/Pair 1.11
Mean z-score -1.75
Structure conservation index 0.76
SVM decision value 0.38
SVM RNA-class probability 0.713127
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 22081767 107 + 23771897
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>DroSec_CAF1 67279 113 + 1
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>DroSim_CAF1 73649 113 + 1
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>DroEre_CAF1 67448 107 + 1
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>DroYak_CAF1 82260 107 + 1
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>consensus
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alignment

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secondary structure

Postscript

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