Locus 7948

Sequence ID 3L_DroMel_CAF1
Location 21,078,032 – 21,078,152
Length 120
Max. P 0.636626
window12965

overview

Window 5

Location 21,078,032 – 21,078,152
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 98.17
Mean single sequence MFE -43.90
Consensus MFE -41.68
Energy contribution -42.28
Covariance contribution 0.60
Combinations/Pair 1.00
Mean z-score -1.23
Structure conservation index 0.95
SVM decision value 0.21
SVM RNA-class probability 0.636626
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 21078032 120 - 23771897
AUUGUUACUAUUGUGUGUCCCAGUUCGAGAGCGACAACUGGAAGACGCGGCCGGAUCACGCGGUGUGCAGCGUGGAAACUGGCCUGCACAUGAUAAAGGCCAUUAAGGAUGUGCGCCUGC
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>DroSec_CAF1 133322 120 - 1
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>DroSim_CAF1 39609 120 - 1
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>DroEre_CAF1 55837 120 - 1
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>DroYak_CAF1 27307 120 - 1
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>consensus
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alignment

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secondary structure

Postscript

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