Locus 7361

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>3L_DroMel_CAF1 19731486 108 + 23771897
UGCAACAGUGCGGCGAAAACGAUCAUCUGCCCAAGGCGCUGCAUGCUGUGCUGCGAGCUAAGAUGAUCUUACUAAAGUGAGUAAAAC--UAGAACAACUAAUGAAAA--GAA--
......(((...((......(((((((((((...)))((((((.((...))))).)))..))))))))((((....))))))...))--).................--...-- ( -24.90)
>DroVir_CAF1 2647 110 + 1
UGCAGCAGAGCAGCGACAAUGAUCAUCUGCCUAAAGCACUGCAUGCGGUGCUGCGUGCCAAGAUGAUAUUGCUAAUGUAUGUGGUUGAUUCGAACAUC---UGCAUAUAUUUC-
(((((..(((((((.(((...(((((((((....(((((((....)))))))....))..)))))))..(((....)))))).)))).)))......)---))))........- ( -35.10)
>DroSec_CAF1 2737 105 + 1
UGCAACAGUGCGGCGAAAACGAUCAUCUGCCCAAGGCGCUGCAUGCAGUGCUGCGAGCUAAGAUGAUCUUACUAAAGUGAGUGAACG--UAGGA---UUAAUGAAAA--GAA--
.(((....))).(((.....((((((((((.(..(((((((....)))))))..).))..))))))))(((((......))))).))--)....---..........--...-- ( -30.60)
>DroSim_CAF1 2735 108 + 1
UGCAACAGUGCGGCGAAAACGAUCAUCUGCCCAAGGCGCUGCAUGCAGUGCUGCGAGCUAAGAUGAUCUUACUAAAGUGAGUAUACG--UAGGACCAUUAAUGAAAA--GAA--
.......((.(.(((.....((((((((((.(..(((((((....)))))))..).))..)))))))).((((......))))..))--).).))............--...-- ( -30.10)
>DroEre_CAF1 2852 110 + 1
UGCAAAAGUGUGGCGAAAACGAUCAACUGCCUAAGGCGCUGCAUGCAGUGCUACGGGCUAAGAUGAUCUUAUUAAAGUGAGUAAAAC--UAGAACAUCCGAUGAAAA--AUUCA
......(((...((......(((((.((((((..(((((((....)))))))..))))..)).)))))((((....))))))...))--).................--..... ( -26.10)
>DroYak_CAF1 2726 107 + 1
UGCAAAAGAGUGGCGAAAACGAUCAUCUGCCCAAGGCGCUGCACGCAGUGCUACGAGCUAAGAUGAUCUUACUAAAGUAAGUAAAAG--UAGAGCAUCAAAUGUAAA--AA---
((((...((...((......((((((((((.(..(((((((....)))))))..).))..))))))))(((((......)))))...--....)).))...))))..--..--- ( -30.00)
>consensus
UGCAACAGUGCGGCGAAAACGAUCAUCUGCCCAAGGCGCUGCAUGCAGUGCUGCGAGCUAAGAUGAUCUUACUAAAGUGAGUAAAAG__UAGAACAUCUAAUGAAAA__GAA__
(((......)))((......((((((((((.(..(((((((....)))))))..).))..))))))))((((....))))))................................ (-23.37 = -22.57 +  -0.80) 

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>3L_DroMel_CAF1 19731486 108 - 23771897
--UUC--UUUUCAUUAGUUGUUCUA--GUUUUACUCACUUUAGUAAGAUCAUCUUAGCUCGCAGCACAGCAUGCAGCGCCUUGGGCAGAUGAUCGUUUUCGCCGCACUGUUGCA
--...--.....(((((.....)))--)).(((((......)))))((((((((..(((.(((((...)).))))))(((...))))))))))).........(((....))). ( -25.90)
>DroVir_CAF1 2647 110 - 1
-GAAAUAUAUGCA---GAUGUUCGAAUCAACCACAUACAUUAGCAAUAUCAUCUUGGCACGCAGCACCGCAUGCAGUGCUUUAGGCAGAUGAUCAUUGUCGCUGCUCUGCUGCA
-........(((.---(((((...............))))).)))...............((((((..(((.((..(((.....)))((..(...)..)))))))..)))))). ( -26.26)
>DroSec_CAF1 2737 105 - 1
--UUC--UUUUCAUUAA---UCCUA--CGUUCACUCACUUUAGUAAGAUCAUCUUAGCUCGCAGCACUGCAUGCAGCGCCUUGGGCAGAUGAUCGUUUUCGCCGCACUGUUGCA
--...--..........---.....--...................((((((((..(((((..((.(((....))).))..))))))))))))).........(((....))). ( -25.90)
>DroSim_CAF1 2735 108 - 1
--UUC--UUUUCAUUAAUGGUCCUA--CGUAUACUCACUUUAGUAAGAUCAUCUUAGCUCGCAGCACUGCAUGCAGCGCCUUGGGCAGAUGAUCGUUUUCGCCGCACUGUUGCA
--...--...........(((...(--(...((((......)))).((((((((..(((((..((.(((....))).))..)))))))))))))))....)))(((....))). ( -30.40)
>DroEre_CAF1 2852 110 - 1
UGAAU--UUUUCAUCGGAUGUUCUA--GUUUUACUCACUUUAAUAAGAUCAUCUUAGCCCGUAGCACUGCAUGCAGCGCCUUAGGCAGUUGAUCGUUUUCGCCACACUUUUGCA
.(((.--...(((.((((((.(((.--(((...........))).))).)))))..(((.(..((.(((....))).))..).))).).))).....))).............. ( -20.30)
>DroYak_CAF1 2726 107 - 1
---UU--UUUACAUUUGAUGCUCUA--CUUUUACUUACUUUAGUAAGAUCAUCUUAGCUCGUAGCACUGCGUGCAGCGCCUUGGGCAGAUGAUCGUUUUCGCCACUCUUUUGCA
---..--...........(((....--...(((((......)))))((((((((..(((((..((.(((....))).))..))))))))))))).................))) ( -28.90)
>consensus
__UUC__UUUUCAUUAGAUGUUCUA__CUUUUACUCACUUUAGUAAGAUCAUCUUAGCUCGCAGCACUGCAUGCAGCGCCUUGGGCAGAUGAUCGUUUUCGCCGCACUGUUGCA
..............................................((((((((..(((((..((.(((....))).))..)))))))))))))......((.(.....).)). (-19.30 = -20.00 +   0.70) 

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