Locus 6867

Sequence ID 3L_DroMel_CAF1
Location 18,453,581 – 18,453,689
Length 108
Max. P 0.668314
window11137

overview

Window 7

Location 18,453,581 – 18,453,689
Length 108
Sequences 6
Columns 114
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 89.39
Mean single sequence MFE -35.17
Consensus MFE -29.30
Energy contribution -29.50
Covariance contribution 0.20
Combinations/Pair 1.13
Mean z-score -1.89
Structure conservation index 0.83
SVM decision value 0.29
SVM RNA-class probability 0.668314
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 18453581 108 - 23771897
CUAUUUGGAGU------ACGACGAUGAUGGCCCGGACUGUUCGUACAGCUACAACUUCAUCCUGAAGCUCAUCACGAUGAUCCUGUACGCACUGGUCUGCAUCAUUGGACUCUU
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>DroSec_CAF1 94202 108 - 1
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>DroSim_CAF1 85043 108 - 1
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>DroEre_CAF1 92425 108 - 1
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>DroYak_CAF1 95235 108 - 1
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>DroAna_CAF1 90637 114 - 1
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>consensus
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