Locus 6829

Sequence ID 3L_DroMel_CAF1
Location 18,331,932 – 18,332,033
Length 101
Max. P 0.970156
window11078

overview

Window 8

Location 18,331,932 – 18,332,033
Length 101
Sequences 6
Columns 107
Reading direction forward
Mean pairwise identity 95.69
Mean single sequence MFE -31.21
Consensus MFE -28.57
Energy contribution -28.90
Covariance contribution 0.33
Combinations/Pair 1.00
Mean z-score -1.64
Structure conservation index 0.92
SVM decision value 1.65
SVM RNA-class probability 0.970156
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 18331932 101 + 23771897
UGGCUAACAGUUGUCAUUGCCAUUAAAGCCAUAAUAUGAGACGAUGUGAUUGCACUCGUUUCGGCUUUCGAGCUGAUGGAAAUGUGGCUAAGGUCUUGUUC------
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>DroSec_CAF1 116175 101 + 1
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>DroSim_CAF1 126230 101 + 1
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>DroEre_CAF1 111963 101 + 1
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>DroYak_CAF1 122593 103 + 1
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>DroAna_CAF1 114169 106 + 1
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>consensus
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