Locus 6791

Sequence ID 3L_DroMel_CAF1
Location 18,241,027 – 18,241,142
Length 115
Max. P 0.967548
window11033

overview

Window 3

Location 18,241,027 – 18,241,142
Length 115
Sequences 6
Columns 116
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 94.17
Mean single sequence MFE -31.87
Consensus MFE -27.81
Energy contribution -27.70
Covariance contribution -0.11
Combinations/Pair 1.16
Mean z-score -2.14
Structure conservation index 0.87
SVM decision value 1.61
SVM RNA-class probability 0.967548
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 18241027 115 - 23771897
UCUUUGGUUUUU-UAUUUUAUAUUUGCGUGCCGAGAUUGGCAAUUGUCAGUUGGAUUUUAUGGUCAGUAGGUGAAAGGCAAGGAGUUGCAGAUAAUGAGAUGUAAACGGUCAAGAG
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>DroSec_CAF1 23730 116 - 1
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>DroSim_CAF1 29677 116 - 1
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>DroEre_CAF1 23921 114 - 1
UCUUUGGUUUUU--GUUUUAUAUUUGCGUGUCGAGAUUGGCAAUUGUCAGUCGGAUUUUAUGGUCAGUAGGUGAAAGGCAAGGAGCUGCAGAUAAUGAGAUGUAAACGGCCAAGAG
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>DroYak_CAF1 30922 114 - 1
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>DroAna_CAF1 27662 114 - 1
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>consensus
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