Locus 6691

Sequence ID 3L_DroMel_CAF1
Location 17,819,654 – 17,819,774
Length 120
Max. P 0.581877
window10890

overview

Window 0

Location 17,819,654 – 17,819,774
Length 120
Sequences 6
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 84.56
Mean single sequence MFE -42.38
Consensus MFE -34.25
Energy contribution -33.06
Covariance contribution -1.19
Combinations/Pair 1.37
Mean z-score -1.64
Structure conservation index 0.81
SVM decision value 0.10
SVM RNA-class probability 0.581877
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 17819654 120 - 23771897
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>DroPse_CAF1 1785 120 - 1
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>DroWil_CAF1 4304 120 - 1
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>DroYak_CAF1 1793 120 - 1
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>DroAna_CAF1 1783 120 - 1
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>DroPer_CAF1 1801 120 - 1
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>consensus
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alignment

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secondary structure

Postscript

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