Locus 6426

Sequence ID 3L_DroMel_CAF1
Location 17,214,792 – 17,214,912
Length 120
Max. P 0.799036
window10299

overview

Window 9

Location 17,214,792 – 17,214,912
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 95.08
Mean single sequence MFE -36.88
Consensus MFE -35.54
Energy contribution -35.30
Covariance contribution -0.24
Combinations/Pair 1.08
Mean z-score -1.18
Structure conservation index 0.96
SVM decision value 0.61
SVM RNA-class probability 0.799036
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 17214792 120 - 23771897
AGCUAUGUAAAAUCUAUGUAAAAUAUUUAUAUUGCACUGAUGCAUCCUGGGGGAGCCGGGCUGAUCUGGCUGCGUGCGUCGUAGCCGCCGUAAUCAGGAGCACGGCAUGGCCUCAAGGAU
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>DroSec_CAF1 98479 117 - 1
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>DroSim_CAF1 91683 117 - 1
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>DroEre_CAF1 101806 114 - 1
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>DroYak_CAF1 104042 114 - 1
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>consensus
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