Locus 5880

Sequence ID 3L_DroMel_CAF1
Location 15,825,029 – 15,825,149
Length 120
Max. P 0.952090
window9374

overview

Window 4

Location 15,825,029 – 15,825,149
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction forward
Mean pairwise identity 98.17
Mean single sequence MFE -41.10
Consensus MFE -40.82
Energy contribution -40.62
Covariance contribution -0.20
Combinations/Pair 1.05
Mean z-score -1.49
Structure conservation index 0.99
SVM decision value 1.42
SVM RNA-class probability 0.952090
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 15825029 120 + 23771897
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>DroSec_CAF1 32409 120 + 1
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>DroSim_CAF1 33616 120 + 1
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>DroEre_CAF1 31330 120 + 1
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>DroYak_CAF1 73598 120 + 1
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>consensus
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