Locus 5597

Sequence ID 3L_DroMel_CAF1
Location 15,362,879 – 15,362,994
Length 115
Max. P 0.938258
window8847

overview

Window 7

Location 15,362,879 – 15,362,994
Length 115
Sequences 6
Columns 120
Reading direction forward
Mean pairwise identity 93.25
Mean single sequence MFE -28.60
Consensus MFE -27.40
Energy contribution -27.40
Covariance contribution 0.00
Combinations/Pair 1.00
Mean z-score -1.24
Structure conservation index 0.96
SVM decision value 1.29
SVM RNA-class probability 0.938258
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 15362879 115 + 23771897
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>DroVir_CAF1 92883 117 + 1
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>DroGri_CAF1 93875 117 + 1
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>DroSim_CAF1 96746 115 + 1
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>DroMoj_CAF1 91325 120 + 1
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>DroAna_CAF1 230021 115 + 1
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>consensus
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