Locus 5161

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>3L_DroMel_CAF1 14180829 116 + 23771897
CCGGCUUUGGCUCUUCCAGUGGCAAUAUACACAUGUGCAUAUAUCUUCGCACAACAUCGACGAAGGCGUCGACUGGAAACAGCCACCUACAAGGCAUCGCCUUUACAAAAAAACUU-
..(((..(((((.(((((((.............(((((..........)))))....(((((....))))))))))))..)))))((.....))....)))...............- ( -33.50)
>DroSec_CAF1 15102 111 + 1
CCGGCUUUGGCUCUUCCAGUGGCAA--UACACAUGUGCAUAUAUCUUCGC--CGCAUCGACGAAGGCGUCGACUGGAAACAGCCACCUACAAGGCAUCGCCUUUACAAA-AAACUU-
..(((..(((((.((((((((((..--.....................))--))).((((((....)))))).)))))..)))))((.....))....)))........-......- ( -31.70)
>DroSim_CAF1 15143 113 + 1
CCGGCUUUGGCUCUUCCAGUGGCAACAUACACAUGUGCAUAUAUCUUCGC--CGCAUCGACGAAGGCGUCGACUGGAAACAGCCACCUACAAGGCAUCGCCUUUACAAA-AAACUU-
..(((..(((((.((((((((((.((((....))))............))--))).((((((....)))))).)))))..)))))((.....))....)))........-......- ( -32.32)
>DroEre_CAF1 15920 112 + 1
CCGCCUUUGGCUCUUCCAGUGGCAAUAUACACAUGUGUAUAUAUCUUCGC--CAUA-UGACGAAGGCGUCGACUGGAAACAGCCACCUACAAGGCAUGGCGUAUACGAU-AGACUU-
.((((..(((((.((((((((((.(((((((....))))))).((((((.--(...-.).)))))).))).)))))))..)))))((.....))...))))........-......- ( -37.90)
>DroYak_CAF1 17619 104 + 1
C---------CUCUUCCAGUGGCAAUAUACCCAUGUGUAUAUAUCUUGGC--CACAUUGACGAAGGCGUCGACUGGAAACAGCCACCUACAAGGCAUCUCGCCAACGAA-AGACUU-
.---------.((((.(..((((.((((((......))))))......((--(...((((((....))))))(((....)))..........))).....))))..).)-)))...- ( -28.70)
>DroPer_CAF1 23868 94 + 1
AUCUCU------------GAGGCAAUCUG---AGGCGGCU----GUGGGC--UCCA-UGACGAAGGCGUUGACUGGAAGCAGCCACCUACAAGGCAACGCAUAAACAAA-AAGCCCA
......------------(.(((....((---(((.((((----((....--((((-(((((....)))))..)))).)))))).))).)).(....)...........-..)))). ( -28.40)
>consensus
CCGGCUUUGGCUCUUCCAGUGGCAAUAUACACAUGUGCAUAUAUCUUCGC__CACAUCGACGAAGGCGUCGACUGGAAACAGCCACCUACAAGGCAUCGCCUUUACAAA_AAACUU_
..................(((((.................................((((((....)))))).((....)))))))............................... (-15.90 = -16.02 +   0.11) 

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>3L_DroMel_CAF1 14180829 116 - 23771897
-AAGUUUUUUUGUAAAGGCGAUGCCUUGUAGGUGGCUGUUUCCAGUCGACGCCUUCGUCGAUGUUGUGCGAAGAUAUAUGCACAUGUGUAUAUUGCCACUGGAAGAGCCAAAGCCGG
-...............(((...(((.....)))((((.(((((((((((((....)))))))...(((....(((((((((....)))))))))..)))))))))))))...))).. ( -38.70)
>DroSec_CAF1 15102 111 - 1
-AAGUUU-UUUGUAAAGGCGAUGCCUUGUAGGUGGCUGUUUCCAGUCGACGCCUUCGUCGAUGCG--GCGAAGAUAUAUGCACAUGUGUA--UUGCCACUGGAAGAGCCAAAGCCGG
-......-........(((...(((.....)))((((.(((((((((((((....))))))...(--((((..((((((....)))))).--))))).)))))))))))...))).. ( -40.90)
>DroSim_CAF1 15143 113 - 1
-AAGUUU-UUUGUAAAGGCGAUGCCUUGUAGGUGGCUGUUUCCAGUCGACGCCUUCGUCGAUGCG--GCGAAGAUAUAUGCACAUGUGUAUGUUGCCACUGGAAGAGCCAAAGCCGG
-......-........(((...(((.....)))((((.(((((((((((((....))))))...(--((((..((((((....))))))...))))).)))))))))))...))).. ( -42.50)
>DroEre_CAF1 15920 112 - 1
-AAGUCU-AUCGUAUACGCCAUGCCUUGUAGGUGGCUGUUUCCAGUCGACGCCUUCGUCA-UAUG--GCGAAGAUAUAUACACAUGUGUAUAUUGCCACUGGAAGAGCCAAAGGCGG
-......-........((((..(((.....)))((((.((((((((.((((....)))).-...(--((...(((((((((....))))))))))))))))))))))))...)))). ( -42.90)
>DroYak_CAF1 17619 104 - 1
-AAGUCU-UUCGUUGGCGAGAUGCCUUGUAGGUGGCUGUUUCCAGUCGACGCCUUCGUCAAUGUG--GCCAAGAUAUAUACACAUGGGUAUAUUGCCACUGGAAGAG---------G
-...(((-((((.((((((.((((((.......(((((....)))))((((....)))).(((((--.............))))))))))).)))))).))))))).---------. ( -35.82)
>DroPer_CAF1 23868 94 - 1
UGGGCUU-UUUGUUUAUGCGUUGCCUUGUAGGUGGCUGCUUCCAGUCAACGCCUUCGUCA-UGGA--GCCCAC----AGCCGCCU---CAGAUUGCCUC------------AGAGAU
.((((..-((((....((((......))))((((((((.(((((....(((....)))..-))))--)....)----))))))).---))))..)))).------------...... ( -29.90)
>consensus
_AAGUUU_UUUGUAAAGGCGAUGCCUUGUAGGUGGCUGUUUCCAGUCGACGCCUUCGUCAAUGUG__GCGAAGAUAUAUGCACAUGUGUAUAUUGCCACUGGAAGAGCCAAAGCCGG
......................(((.....)))((((.((((((((.((((....))))........((((..((((((....))))))...)))).))))))))))))........ (-16.93 = -19.95 +   3.02) 

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