Locus 5149

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>3L_DroMel_CAF1 14154850 102 + 23771897
UGCCAAUGCAACAGCUGAACUUGAGCUCCUUUGCUUUGUUUACGCUGUGUUGCUACGACAUCG--UACCUGUUGCACC---UGUUCAACAAGUCUCAUUGGCCUCU---U
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>DroGri_CAF1 148188 105 + 1
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((((...(((((.(((.....(((((.......-...)))))..))).)))))..))-))...--.((((((((.((.....)).))))))))..-.............. ( -25.50)
>DroSec_CAF1 152719 104 + 1
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.(((((((..((((((((((..((((......)))).))))).)))))((((....((((..(((((.....))))).---))))))))......)))))))....---. ( -33.10)
>DroSim_CAF1 155655 105 + 1
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..((..(((.((((((((((..((((......)))).))))).))))).(((((..(((((((((((.....)))))))--)))).))))))))..))........---. ( -34.30)
>DroEre_CAF1 153350 102 + 1
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>DroAna_CAF1 150610 99 + 1
UGCCAAUGCAACAGCUGAACUUGAGCUCCUUUGGUCUGUUUCCUCUGCGUUGCCAGGACAUUG--CACCUGUUGCUU----GGAUCAACAAGUC-CACUGUCCAUU----
((.((((((((((((..((..........))..).))))......))))))).))(((((.((--.((.(((((...----....))))).)).-)).)))))...---- ( -26.20)
>consensus
UGCCAAUGCAACAGCUGAACUUGAGCUCCUUUGCUUUGUUUACGCUGUGUUGCUACGACAUCG__UACCUGUUGCACC___UGUUCAACAAGUCUCAUUGGCCUCU___U
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>3L_DroMel_CAF1 14154850 102 - 23771897
A---AGAGGCCAAUGAGACUUGUUGAACA---GGUGCAACAGGUA--CGAUGUCGUAGCAACACAGCGUAAACAAAGCAAAGGAGCUCAAGUUCAGCUGUUGCAUUGGCA
.---....(((((((..((..(((((((.---.(.((..(.(.((--((....)))).)......((.........))...)..)).)..))))))).))..))))))). ( -34.00)
>DroGri_CAF1 148188 105 - 1
AGGAUAAGGACGAG-ACACUUGUUGAACUGAAAAUGCAACAAGUU--UGAUG-CCUGGCAACGGCUUGUAAACAAU-AAAUUGAGCUCAAGUUCAGCUGUUGCAUUGGCA
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>DroSec_CAF1 152719 104 - 1
A---AGAGGCCAAUGAGACUUGUUGAACA---GGUGCAACAGGUACACGAUGUCGUAGCAACACAGCGUAAACAAAGCAAAGGAGCUCAAGUUCAGCUGUUGCAUUGGCA
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>DroSim_CAF1 155655 105 - 1
U---UUAUCCCCCCCCCACUUGUUGAACA--UCGUGCAACAGGUACACGAUGUCGUAACAACACAGCGUAAACAAAGCAAAGGAGCUCAAGUUCAACUGUUGCAUUGGCA
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>DroEre_CAF1 153350 102 - 1
A---AGAGGCCAACGAGACUUGUUGAACA---GGUGCAACAGGUA--CGAUGUCGUAGCAACACAGCGUAAACAAUGCAAAUGAGCCCAAGUUCAGCUGUUGCAUUGGCA
.---....(((((.(..((..(((((((.---((.((....(.((--((....)))).)......((((.....))))......))))..))))))).))..).))))). ( -31.70)
>DroAna_CAF1 150610 99 - 1
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>consensus
A___AGAGGCCAAUGAGACUUGUUGAACA___GGUGCAACAGGUA__CGAUGUCGUAGCAACACAGCGUAAACAAAGCAAAGGAGCUCAAGUUCAGCUGUUGCAUUGGCA
........(((((....((((((((.((.....)).)))))))).............((((((....(....).........((((....))))...)))))).))))). (-20.14 = -20.62 +   0.48) 

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