Locus 4433

Sequence ID 3L_DroMel_CAF1
Location 12,940,755 – 12,940,875
Length 120
Max. P 0.510118
window6874

overview

Window 4

Location 12,940,755 – 12,940,875
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 89.58
Mean single sequence MFE -34.22
Consensus MFE -24.56
Energy contribution -24.76
Covariance contribution 0.20
Combinations/Pair 1.24
Mean z-score -1.70
Structure conservation index 0.72
SVM decision value -0.05
SVM RNA-class probability 0.510118
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 12940755 120 - 23771897
ACUUUGUAUUCGGCUCUAGCCUAGUAGGUGCCACUAUUGCCAUUUGUAUGUCAAGUGUUUCUAUAAUGCUACUGGACUUAGCAUCUGCCUUCAAAUAUGCCAGUGGUCUAGUGGCAUUCG
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>DroSec_CAF1 58010 120 - 1
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>DroSim_CAF1 62248 120 - 1
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>DroEre_CAF1 64191 120 - 1
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>DroYak_CAF1 61711 120 - 1
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>consensus
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alignment

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