Locus 4356

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Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 12787775 107 + 23771897
UGCGGUCGCGGUUCGUCUCCGACCAGGAGGCUACGCCUCCGCUGCCGGUCUUGCCGCCGGCGCGGUUUUGGAAGUCCAUUUUGU-AAACUU-UAUUUUAG------UUUUCAACC
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>DroPse_CAF1 54304 97 + 1
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.(((((.(((....((((((.....))))))..))).)))))(((((((......)))))))....(((((((.......))))-)))...-.-......--------------- ( -37.40)
>DroGri_CAF1 44192 109 + 1
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>DroYak_CAF1 31687 108 + 1
UGCGGUCGCGGUUCGUCUCCGACCAGGAGGCCACGCCUCCGCUGCCGGUCUUGCCGCCGGCGCGGUUCUGGAAGUCCAUUGUGU-AAGUUUUUUUCUUAG------UUUUUACCC
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>DroAna_CAF1 22138 105 + 1
UGCGGUCGCGGUUCGAUUCCGACCAGGAGGCAACGCCUCCGCUGCCGGUCUUGCCACCGGCGCGGUUCUGAAAGUCCAUUUUUC-CAAGAU-UAUUUCAA------UUUAUUU--
...(((((.((......))))))).((((((...))))))((.((((((......))))))))...((((((((.....)))))-..))).-........------.......-- ( -34.80)
>DroPer_CAF1 52624 98 + 1
UGCGGUCGCGGUUGGUCUCCGACCAGGAGGCAACGCCACCGCUGCCGGUUUUGCCACCGGCACGAUUUUGAAAGUCCAUAUUUU-AAGUUU-UUUUUUAG---------------
.(((((.(((....((((((.....))))))..))).)))))(((((((......)))))))....(((((((.......))))-)))...-........--------------- ( -37.40)
>consensus
UGCGGUCGCGGUUCGUCUCCGACCAGGAGGCAACGCCACCGCUGCCGGUCUUGCCACCGGCGCGAUUUUGAAAGUCCAUUUUUU_AAAUUU_UAUUUUAG______UUUUUA___
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Window 4

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>3L_DroMel_CAF1 12787775 107 - 23771897
GGUUGAAAA------CUAAAAUA-AAGUUU-ACAAAAUGGACUUCCAAAACCGCGCCGGCGGCAAGACCGGCAGCGGAGGCGUAGCCUCCUGGUCGGAGACGAACCGCGACCGCA
(((((.(((------((......-.)))))-.)....(((....))).))))((((((((.....).))))).((((((((...)))))).(((((....)).)))))....)). ( -42.20)
>DroPse_CAF1 54304 97 - 1
---------------CUAAAA-A-AAACUU-AAAAUAUGGACUUUCAAAAUCGUGCCGGUGGCAAAACCGGCAGCGGUGGCGUUGCCUCCUGGUCGGAGACCAACCGCGACCGCA
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>DroGri_CAF1 44192 109 - 1
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>DroYak_CAF1 31687 108 - 1
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.(((.....------.((((.......)))-).....(((....)))..)))((((((((.....).))))).((((((((...)))))).(((((....)).)))))....)). ( -39.60)
>DroAna_CAF1 22138 105 - 1
--AAAUAAA------UUGAAAUA-AUCUUG-GAAAAAUGGACUUUCAGAACCGCGCCGGUGGCAAGACCGGCAGCGGAGGCGUUGCCUCCUGGUCGGAAUCGAACCGCGACCGCA
--.......------((((((..-.(((..-.......))).))))))......((((((......)))))).((((((((...)))))).((((((........).))))))). ( -34.60)
>DroPer_CAF1 52624 98 - 1
---------------CUAAAAAA-AAACUU-AAAAUAUGGACUUUCAAAAUCGUGCCGGUGGCAAAACCGGCAGCGGUGGCGUUGCCUCCUGGUCGGAGACCAACCGCGACCGCA
---------------........-......-......................(((((((......)))))))(((((.((((((.((((.....))))..))).))).))))). ( -36.00)
>consensus
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