Locus 808

Sequence ID 2R_DroMel_CAF1
Location 3,822,490 – 3,822,600
Length 110
Max. P 0.999921
window1414

overview

Window 4

Location 3,822,490 – 3,822,600
Length 110
Sequences 6
Columns 113
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 95.14
Mean single sequence MFE -34.43
Consensus MFE -32.55
Energy contribution -32.55
Covariance contribution 0.00
Combinations/Pair 1.08
Mean z-score -2.85
Structure conservation index 0.95
SVM decision value 4.56
SVM RNA-class probability 0.999921
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2R_DroMel_CAF1 3822490 110 - 20766785
AGACUGCCGGAAUUCCACUUACACUUGUCUCAUAUUUCCAGCCAUGCAAAGUGCAGCAAAACUAUUGUUGCAGUCACAAACUGCAUGUGGAAAUAGACGACGAGGGACG---A
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>DroSec_CAF1 78954 110 - 1
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>DroSim_CAF1 95570 110 - 1
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>DroEre_CAF1 79717 110 - 1
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>DroYak_CAF1 76289 110 - 1
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>DroAna_CAF1 76865 113 - 1
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>consensus
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