Locus 6248

Sequence ID 2R_DroMel_CAF1
Location 19,618,942 – 19,619,062
Length 120
Max. P 0.982857
window10002

overview

Window 2

Location 19,618,942 – 19,619,062
Length 120
Sequences 6
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 94.33
Mean single sequence MFE -47.93
Consensus MFE -44.14
Energy contribution -44.95
Covariance contribution 0.81
Combinations/Pair 1.07
Mean z-score -1.72
Structure conservation index 0.92
SVM decision value 1.93
SVM RNA-class probability 0.982857
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2R_DroMel_CAF1 19618942 120 - 20766785
UCUGCUCGAGUACUGGUGCAUGGUGGACUUUGUGCGACCCAACUACCUGGGCACCCGCACGGAGUUCUGCAACAUGUUCGAGCGUCCCAUCCAGAAUGGCCAGUGCGUGGACUCCACGCC
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>DroSec_CAF1 2175 120 - 1
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>DroSim_CAF1 2232 120 - 1
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>DroEre_CAF1 2407 120 - 1
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>DroYak_CAF1 2239 120 - 1
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>DroAna_CAF1 2237 120 - 1
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>consensus
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