Locus 5502

Sequence ID 2R_DroMel_CAF1
Location 17,654,623 – 17,654,742
Length 119
Max. P 0.584143
window8797

overview

Window 7

Location 17,654,623 – 17,654,742
Length 119
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 91.88
Mean single sequence MFE -31.06
Consensus MFE -22.67
Energy contribution -23.91
Covariance contribution 1.24
Combinations/Pair 1.13
Mean z-score -1.92
Structure conservation index 0.73
SVM decision value 0.10
SVM RNA-class probability 0.584143
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2R_DroMel_CAF1 17654623 119 - 20766785
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>DroSec_CAF1 8203 117 - 1
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>DroSim_CAF1 14119 117 - 1
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>DroEre_CAF1 8405 115 - 1
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>DroYak_CAF1 19846 117 - 1
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>consensus
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