Locus 5066

Sequence ID 2R_DroMel_CAF1
Location 16,453,242 – 16,453,359
Length 117
Max. P 0.500000
window8098

overview

Window 8

Location 16,453,242 – 16,453,359
Length 117
Sequences 6
Columns 117
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 95.67
Mean single sequence MFE -41.95
Consensus MFE -37.26
Energy contribution -37.48
Covariance contribution 0.22
Combinations/Pair 1.06
Mean z-score -1.14
Structure conservation index 0.89
SVM decision value -0.07
SVM RNA-class probability 0.500000
Prediction OTHER

Download alignment: ClustalW | MAF

>2R_DroMel_CAF1 16453242 117 - 20766785
GUGGAUGGGGCCAGGGAGGUGAUCUCCUUCUGCAUACGAUCGGCAAUACCGGGGUACAUGGUGGUGCCACCGGACAUGACGAUGUUGGCGUACAGGUCCUUACGGAUAUCCACAUCG
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>DroGri_CAF1 151390 117 - 1
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>DroSim_CAF1 125439 117 - 1
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>DroWil_CAF1 285227 117 - 1
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>DroMoj_CAF1 212589 117 - 1
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>DroAna_CAF1 125252 117 - 1
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>consensus
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alignment

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