Locus 435

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>2R_DroMel_CAF1 2511015 101 + 20766785
ACUGACCG-AAAUUGGAU-------UCUAAAUGACUUGGCAU--UCCUUUCAGUACGCCAUCUGCAUGCUGAUUCUGUUCGGCCUGCAACUGGCCCUCUCCAUCUGGAUCU
(((((...-.....(((.-------.((((.....))))...--)))..)))))..((((..((((.(((((......))))).))))..))))....(((....)))... ( -27.00)
>DroSec_CAF1 20627 101 + 1
ACUGACCC-AAAUGGGAA-------GCUAACUGACUUACCAU--UCCUUCCAGUACGCCAUCUGCAUGCUGAUUCUGUUCGGCCUGCAACUGGCGCUCUCCAUCUGGAUCU
...((.((-(.((((..(-------((..((((.........--......))))..((((..((((.(((((......))))).))))..)))))))..)))).))).)). ( -37.66)
>DroSim_CAF1 20753 101 + 1
ACUGACCC-AAAUUGGAA-------GCUAACCGACUUGCCAU--UCCUUCCAGUACGCCAUCUGCAUGCUGAUUCUGUUCGGCCUGCAACUGGCCCUCUCCAUCUGGAUCU
...((.((-(.(((((((-------(................--..))))))))..((((..((((.(((((......))))).))))..))))..........))).)). ( -29.67)
>DroEre_CAF1 20849 101 + 1
ACUGACCC-AAGCCGUAA-------GCUGACUGGUCUGCUCU--CUGUUCCAGUACGCCAUCUGCAUGCUGAUUCUGUUCGGCCUCCAGCUGGCCCUCUCCAUUUGGAUCU
...((.((-(((......-------....(((((...((...--..)).)))))..((((.(((...(((((......)))))...))).))))........))))).)). ( -28.30)
>DroYak_CAF1 20067 108 + 1
UCUAAACC-AAACCGGAUACUGGAUACUGACUGGUCUGCUCU--CCUUUCCAGUACGCCAUCUGCAUGCUGAUACUGUUCGGCCUCCAGCUGGCCCUCUCCAUUUGGAUCU
......((-(((..((((((((((....(((......).)).--....))))))).((((.(((...(((((......)))))...))).))))....))).))))).... ( -32.50)
>DroPer_CAF1 22634 100 + 1
G-UGAUCCGGAAUUCCAU-------UCUGAU---GUUACUAUUUUCUCUGUAGUAUGCCAUCUGUAUGCUGGUCUUGUUUGCCCUGCAAUUGGCUCUGUCGAUUUGGAUCU
.-.(((((((....))..-------..((((---..((((((.......)))))).((((..((((....(((.......))).))))..))))...))))....))))). ( -24.20)
>consensus
ACUGACCC_AAAUUGGAA_______GCUAACUGACUUGCCAU__UCCUUCCAGUACGCCAUCUGCAUGCUGAUUCUGUUCGGCCUGCAACUGGCCCUCUCCAUCUGGAUCU
................................................(((((...((((..((((.(((((......))))).))))..)))).........)))))... (-17.33 = -17.13 +  -0.19) 

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>2R_DroMel_CAF1 2511015 101 - 20766785
AGAUCCAGAUGGAGAGGGCCAGUUGCAGGCCGAACAGAAUCAGCAUGCAGAUGGCGUACUGAAAGGA--AUGCCAAGUCAUUUAGA-------AUCCAAUUU-CGGUCAGU
.((((.(((((((...(((...(((((.((.((......)).)).))))).((((((.((....)).--)))))).))).......-------.))).))))-.))))... ( -28.20)
>DroSec_CAF1 20627 101 - 1
AGAUCCAGAUGGAGAGCGCCAGUUGCAGGCCGAACAGAAUCAGCAUGCAGAUGGCGUACUGGAAGGA--AUGGUAAGUCAGUUAGC-------UUCCCAUUU-GGGUCAGU
.(((((((((((..(((((((.(((((.((.((......)).)).))))).))))..(((((.....--........)))))..))-------)..))))))-)))))... ( -42.52)
>DroSim_CAF1 20753 101 - 1
AGAUCCAGAUGGAGAGGGCCAGUUGCAGGCCGAACAGAAUCAGCAUGCAGAUGGCGUACUGGAAGGA--AUGGCAAGUCGGUUAGC-------UUCCAAUUU-GGGUCAGU
.(((((((((..((.(.((((.(((((.((.((......)).)).))))).)))).).))(((((..--.((((......)))).)-------)))).))))-)))))... ( -36.70)
>DroEre_CAF1 20849 101 - 1
AGAUCCAAAUGGAGAGGGCCAGCUGGAGGCCGAACAGAAUCAGCAUGCAGAUGGCGUACUGGAACAG--AGAGCAGACCAGUCAGC-------UUACGGCUU-GGGUCAGU
.(((((...(((......))).....((((((.......((((.((((.....)))).)))).....--.((((.((....)).))-------)).))))))-)))))... ( -30.60)
>DroYak_CAF1 20067 108 - 1
AGAUCCAAAUGGAGAGGGCCAGCUGGAGGCCGAACAGUAUCAGCAUGCAGAUGGCGUACUGGAAAGG--AGAGCAGACCAGUCAGUAUCCAGUAUCCGGUUU-GGUUUAGA
.((.(((((((((..((((((.(((.(.((.((......)).)).).))).))))(((((((...((--........))..)))))))))....))).))))-)).))... ( -31.40)
>DroPer_CAF1 22634 100 - 1
AGAUCCAAAUCGACAGAGCCAAUUGCAGGGCAAACAAGACCAGCAUACAGAUGGCAUACUACAGAGAAAAUAGUAAC---AUCAGA-------AUGGAAUUCCGGAUCA-C
.(((((.........((((((..(((.((..........)).)))......)))).(((((.........)))))..---.))...-------..((....))))))).-. ( -20.80)
>consensus
AGAUCCAAAUGGAGAGGGCCAGUUGCAGGCCGAACAGAAUCAGCAUGCAGAUGGCGUACUGGAAGGA__AUAGCAAGUCAGUCAGC_______AUCCAAUUU_GGGUCAGU
.((((((((((((...((((.......))))........((((.((((.....)))).))))................................))).)))).)))))... (-16.94 = -17.70 +   0.76) 

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