Locus 4153

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>2R_DroMel_CAF1 13659797 104 + 20766785
-CA---CUAAUGGCAC-CAUUGCUAUUUUUCUUGCAGAUUCUGAGAAGCUCAUUGCCUCGUUGCUGGCCAACGCCAAGCCGCAGGAGCAGAAACAGAUCCUGGGCGAGC
-..---..(((((((.-...))))))).(((((.........)))))((((.............((((....)))).(((.(((((...........)))))))))))) ( -29.00)
>DroPse_CAF1 17088 100 + 1
UUA---UUAUUU--C-UCUUCUCUCU---UCUUUCAGACUCUGAGAAGCUCAUUGCCUCAUUGUUGGCUAAUGCCAAUCCCCAGGAGCAGAAACAGAUCCUGGGCGAGC
...---....((--(-((...(((..---......)))....)))))((((...........((((((....)))))).(((((((...........))))))).)))) ( -29.10)
>DroWil_CAF1 18674 100 + 1
UUU---UAAUUU--G-UGUGUCCCUG---UUUUGCAGAUCCCGAGAAGCUUAUUGCUUCGCUAUUGGCUAAUGCCAAGCCACAGGAGCAGAAACAGAUCCUGGGCGAGC
...---......--.-.......(((---.....))).......(((((.....)))))(((.(((((....)))))(((.(((((...........)))))))).))) ( -30.30)
>DroYak_CAF1 16794 96 + 1
-UA---CUAAUGGCAC------CAAU---UUUUGCAGAUUCUGAGAAGCUCAUUGCCUCGUUGCUGGCCAACGCCAAGCCGCAGGAGCAGAAACAGAUCCUCGGCGAGC
-..---....((((..------....---....((((....((((...))))))))...((((.....)))))))).((((.((((...........)))))))).... ( -24.20)
>DroMoj_CAF1 17966 105 + 1
GUAAUCUUAAUAUUUU-CAUUUCAAU---UUUUGUAGACCAAGAGAAGCUCAUUGCCUCAUUGUUGGCUAACGCCAAGCCCCAAGAACAGAAACAAAUUCUGGGCGAAC
................-........(---(((((.....)))))).......(((((......(((((....)))))..........(((((.....)))))))))).. ( -20.10)
>DroPer_CAF1 16349 100 + 1
UUA---UUAUUU--C-UUUUCUCACU---UCUUUCAGACUCUGAGAAGCUCAUUGCCUCAUUGUUGGCUAAUGCCAAUCCCCAGGAGCAGAAACAGAUCCUGGGCGAGC
...---......--.-..((((((..---((.....))...))))))((((...........((((((....)))))).(((((((...........))))))).)))) ( -29.70)
>consensus
UUA___UUAAUU__A__CUUUUCAAU___UCUUGCAGACUCUGAGAAGCUCAUUGCCUCAUUGUUGGCUAACGCCAAGCCCCAGGAGCAGAAACAGAUCCUGGGCGAGC
...............................................((((.............((((....)))).(((.(((((...........)))))))))))) (-17.24 = -18.13 +   0.89) 

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>2R_DroMel_CAF1 13659797 104 - 20766785
GCUCGCCCAGGAUCUGUUUCUGCUCCUGCGGCUUGGCGUUGGCCAGCAACGAGGCAAUGAGCUUCUCAGAAUCUGCAAGAAAAAUAGCAAUG-GUGCCAUUAG---UG-
((..((((((((.(.......).))))).))).((((....)))))).....((((.((((...)))).....(((..........)))...-.)))).....---..- ( -28.80)
>DroPse_CAF1 17088 100 - 1
GCUCGCCCAGGAUCUGUUUCUGCUCCUGGGGAUUGGCAUUAGCCAACAAUGAGGCAAUGAGCUUCUCAGAGUCUGAAAGA---AGAGAGAAGA-G--AAAUAA---UAA
((((((((((((.(.......).)))))))..(((((....)))))...........)))))(((((....(((......---))).....))-)--))....---... ( -30.20)
>DroWil_CAF1 18674 100 - 1
GCUCGCCCAGGAUCUGUUUCUGCUCCUGUGGCUUGGCAUUAGCCAAUAGCGAAGCAAUAAGCUUCUCGGGAUCUGCAAAA---CAGGGACACA-C--AAAUUA---AAA
.........(..(((((((.((((((((..(((((((....))))..)))(((((.....))))).)))))...))))))---))))..)...-.--......---... ( -31.20)
>DroYak_CAF1 16794 96 - 1
GCUCGCCGAGGAUCUGUUUCUGCUCCUGCGGCUUGGCGUUGGCCAGCAACGAGGCAAUGAGCUUCUCAGAAUCUGCAAAA---AUUG------GUGCCAUUAG---UA-
....((((((((.(.......).)))).)))).((((((((.....))))(((((.....)))))...............---....------..))))....---..- ( -27.10)
>DroMoj_CAF1 17966 105 - 1
GUUCGCCCAGAAUUUGUUUCUGUUCUUGGGGCUUGGCGUUAGCCAACAAUGAGGCAAUGAGCUUCUCUUGGUCUACAAAA---AUUGAAAUG-AAAAUAUUAAGAUUAC
.((((((((((((........)))))..))))(((((....)))))(((((((((.....)))))..(((.....)))..---))))....)-)).............. ( -24.50)
>DroPer_CAF1 16349 100 - 1
GCUCGCCCAGGAUCUGUUUCUGCUCCUGGGGAUUGGCAUUAGCCAACAAUGAGGCAAUGAGCUUCUCAGAGUCUGAAAGA---AGUGAGAAAA-G--AAAUAA---UAA
((((((((((((.(.......).)))))))..(((((....)))))...........)))))((((((...((.....))---..))))))..-.--......---... ( -31.30)
>consensus
GCUCGCCCAGGAUCUGUUUCUGCUCCUGGGGCUUGGCAUUAGCCAACAACGAGGCAAUGAGCUUCUCAGAAUCUGCAAAA___AUUGAAAAG__G__AAAUAA___UAA
....((((((((.(.......).))))).)))(((((....)))))....(((((.....)))))............................................ (-20.00 = -20.03 +   0.03) 

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