Locus 2667

Sequence ID 2R_DroMel_CAF1
Location 9,409,026 – 9,409,130
Length 104
Max. P 0.602509
window4387

overview

Window 7

Location 9,409,026 – 9,409,130
Length 104
Sequences 6
Columns 104
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 83.40
Mean single sequence MFE -37.19
Consensus MFE -26.06
Energy contribution -26.70
Covariance contribution 0.64
Combinations/Pair 1.39
Mean z-score -1.93
Structure conservation index 0.70
SVM decision value 0.14
SVM RNA-class probability 0.602509
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2R_DroMel_CAF1 9409026 104 - 20766785
GGUAGGGAUAGUCUGGUGCCACUAGAGGUGGCUGUUAGUGAGGGACUGGUGCGCCAGGAGGUGUACGAGAUGUUUAGCCGUGGCAUUGGCGUUCAGAAUGCCAG
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>DroVir_CAF1 21551 104 - 1
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>DroGri_CAF1 20314 104 - 1
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>DroSec_CAF1 20890 104 - 1
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>DroWil_CAF1 20699 104 - 1
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>DroAna_CAF1 20780 104 - 1
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>consensus
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((((.((((...((((((((((........((.....))(((.((((.(((.(((....))).))).)))).)))....)))))))))).))))....)))).. (-26.06 = -26.70 +   0.64)

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