Locus 2362

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>2R_DroMel_CAF1 8582155 105 + 20766785
AUUUGGCUGAGAUUUCCUAGACACCAAGAAAGUUAACUUGGCUCGAAAGAAAUGCUAAUGUUCUCCCUAGAGGGAGAAGUGC--------UUUUAAAGAGGGAGCGAA----AGACU
..(((((................(((((........))))).((....))...)))))..(((((((....))))))).(((--------((((.....)))))))..----..... ( -27.10)
>DroPse_CAF1 15927 95 + 1
AUUUCUAGGAGAUUUUCACAGAAGCAGAA-AGUUAACUUU-CCCGAAAGAAAUGCUAAUGUUUUCCCUAGAGGAGGAA------------------AGGAGGAGCACAUU--AGACA
.((((((((.((.....(((..(((((((-((....))))-).(....)...))))..)))..)))))))))).....------------------..............--..... ( -21.40)
>DroSec_CAF1 57624 104 + 1
AUUUGGCAGAGAUUUCCUAGACACCAAGA-AGUUAACUUGGCUCGAAAGAAAUGCUAAUGUUCUCCCUAGAGGGAGAUGUGC--------UUUUAAAGAGGGAGCAAA----AGACU
..((((((...............(((((.-......))))).((....))..))))))...((((((....))))))..(((--------((((.....)))))))..----..... ( -27.90)
>DroEre_CAF1 48444 103 + 1
AUUCGGCAGAGAUUUCCUAGACGCCAAGA-AGUUAACUUGGCUCGAAAGAAAUGCUAAUGUU-CCCCUAGAGGGAGAAGCGU--------CUUUAAAGAGGGAACGAA----GGACU
.(((((((....((((...((.((((((.-......))))))))))))....))))...(((-(((((..(((((......)--------))))..)).)))))))))----..... ( -30.70)
>DroYak_CAF1 61166 103 + 1
AUUUGGCAGAGAUUUC-GAGGCACCAAGA-AGUUAACUUGGCUCGAAAGAAAUGCUAAUGUUUUCCCUAGAGGGAGAAGUGC--------UUUUAAAGAGGGAACGAA----GGACU
..((((((....((((-(((...(((((.-......))))))))))))....))))))..(((((((....)))))))((.(--------(((............)))----).)). ( -30.50)
>DroAna_CAF1 8368 116 + 1
AUUUGGCAGAGAUUCCCGCCACACCAAGA-AGUUAACUUGGCUCGAAAGAAAUGCUAAUGUUCUCUCUGGAGGUAGCGGCACGAGGGAUUCUCUGAAGACGACCCAAAUAUGAGGUU
..((..((((((.(((((((.((((.(((-.(..((((((((((....))...))))).)))..))))...))).).)))....)))).))))))..)).((((((....)).)))) ( -37.70)
>consensus
AUUUGGCAGAGAUUUCCUAGACACCAAGA_AGUUAACUUGGCUCGAAAGAAAUGCUAAUGUUCUCCCUAGAGGGAGAAGUGC________UUUUAAAGAGGGAGCAAA____AGACU
..((((((...............(((((........))))).((....))..))))))..(((((((....)))))))....................................... (-12.44 = -14.17 +   1.73) 

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>2R_DroMel_CAF1 8582155 105 - 20766785
AGUCU----UUCGCUCCCUCUUUAAAA--------GCACUUCUCCCUCUAGGGAGAACAUUAGCAUUUCUUUCGAGCCAAGUUAACUUUCUUGGUGUCUAGGAAAUCUCAGCCAAAU
.....----...(((............--------((..(((((((....))))))).....))(((((((....((((((........))))))....)))))))...)))..... ( -26.10)
>DroPse_CAF1 15927 95 - 1
UGUCU--AAUGUGCUCCUCCU------------------UUCCUCCUCUAGGGAAAACAUUAGCAUUUCUUUCGGG-AAAGUUAACU-UUCUGCUUCUGUGAAAAUCUCCUAGAAAU
((.((--(((((..((((...------------------...........))))..))))))))).........((-((((....))-))))..(((((.((.....)).))))).. ( -19.34)
>DroSec_CAF1 57624 104 - 1
AGUCU----UUUGCUCCCUCUUUAAAA--------GCACAUCUCCCUCUAGGGAGAACAUUAGCAUUUCUUUCGAGCCAAGUUAACU-UCUUGGUGUCUAGGAAAUCUCUGCCAAAU
.((((----((((.........)))))--------).)).((((((....))))))......(((((((((....((((((......-.))))))....))))))....)))..... ( -25.90)
>DroEre_CAF1 48444 103 - 1
AGUCC----UUCGUUCCCUCUUUAAAG--------ACGCUUCUCCCUCUAGGGG-AACAUUAGCAUUUCUUUCGAGCCAAGUUAACU-UCUUGGCGUCUAGGAAAUCUCUGCCGAAU
.....----((((((((((......((--------(....))).......))))-)))....(((((((((....((((((......-.))))))....))))))....))).))). ( -26.52)
>DroYak_CAF1 61166 103 - 1
AGUCC----UUCGUUCCCUCUUUAAAA--------GCACUUCUCCCUCUAGGGAAAACAUUAGCAUUUCUUUCGAGCCAAGUUAACU-UCUUGGUGCCUC-GAAAUCUCUGCCAAAU
.....----..................--------.......((((....))))........(((....((((((((((((......-.)))))...)))-))))....)))..... ( -20.20)
>DroAna_CAF1 8368 116 - 1
AACCUCAUAUUUGGGUCGUCUUCAGAGAAUCCCUCGUGCCGCUACCUCCAGAGAGAACAUUAGCAUUUCUUUCGAGCCAAGUUAACU-UCUUGGUGUGGCGGGAAUCUCUGCCAAAU
........((((((........((((((.((((....(((((........(((((((.........)))))))..((((((......-.))))))))))))))).)))))))))))) ( -37.70)
>consensus
AGUCU____UUCGCUCCCUCUUUAAAA________GCACUUCUCCCUCUAGGGAGAACAUUAGCAUUUCUUUCGAGCCAAGUUAACU_UCUUGGUGUCUAGGAAAUCUCUGCCAAAU
..........................................((((....)))).......((.((((((.....((((((........)))))).....))))))))......... (-11.17 = -11.87 +   0.70) 

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