Locus 2031

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>2R_DroMel_CAF1 7674762 104 + 20766785
--CAUACCACUG-UGU--AUUUCG-CAGAUCAUCUUU--GGCGUGAGGUUUGCAACAAGGGGAUG--AUCAAAUACAUAUCACUUUGCUACAAAUCACACACCCAAAAUGCCCG------
--.......(((-((.--....))-)))..(((.(((--((.(((.((((((...(((((.((((--..........)))).)))))...)))))).)))..))))))))....------ ( -23.20)
>DroVir_CAF1 4465 104 + 1
UUUAUAUUGCUG-GUU--AAAU----GCGCCACCUUU--GGCGUGAGGUUUGCAACAAGGGGAUGGAAUCCAA-GCUCAUCACUUUGCCACAAAUCACACGCCCAAAAUGCGCA------
............-...--...(----((((.......--((((((.((((((...(((((.(((((.......-..))))).)))))...)))))).))))))......)))))------ ( -32.12)
>DroPse_CAF1 3154 113 + 1
AUUAUAUGAGAG-UGU--AGGUGUGGGAUUCAACUUU--GGCGUGAGGUUUGCAACAAGGGGAUG--AUCAAAUGCAUAUCACUUUGCCACAAAUCACACACCCAAAAUGUCCACAGUCU
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>DroGri_CAF1 5406 103 + 1
UUAAUAUUGUUG-CUU--AGAU----GCGCCACCUUC--GGCGUGAGGUUUGCAACAAGGGGAUGGAAUC-AA-GCUCAUCACUUUGCCACAAAUCACACGCCCAAAAUGCACA------
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>DroWil_CAF1 4409 100 + 1
-------GACUGAUGU--AUUUGG--A-GACAUCUUUCCGGCGUGAGGUUUGCAACAAGGGGAUU--AUCAAGUACAUAUCACUUUGCUACAAAUCACACGCCCGAAAUGCCCA------
-------.......((--((((((--(-((....)))))((((((.((((((...(((((.(((.--...........))).)))))...)))))).))))))..))))))...------ ( -28.90)
>DroAna_CAF1 4457 102 + 1
--C----UGAUA-UGUUGCCGUUG-GAAAGCACCUUG--GGCGUGAGGUUUGCAACAAGGGGAUG--AUCAAAUACCUAUCACUUUGCCACAAAUCACACACCCAAAAUGUCCA------
--.----.((((-(......(((.-...)))...(((--((.(((.((((((...(((((.((((--..........)))).)))))...)))))).))).))))).)))))..------ ( -27.90)
>consensus
__CAUAUUACUG_UGU__AGAU_G__AAGCCACCUUU__GGCGUGAGGUUUGCAACAAGGGGAUG__AUCAAAUACAUAUCACUUUGCCACAAAUCACACACCCAAAAUGCCCA______
.......................................((.(((.((((((...(((((.((((............)))).)))))...)))))).))).))................. (-16.55 = -16.55 +   0.00) 

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>2R_DroMel_CAF1 7674762 104 - 20766785
------CGGGCAUUUUGGGUGUGUGAUUUGUAGCAAAGUGAUAUGUAUUUGAU--CAUCCCCUUGUUGCAAACCUCACGCC--AAAGAUGAUCUG-CGAAAU--ACA-CAGUGGUAUG--
------((((((((((.((((((.(.((((((((((.(((((.........))--)))....)))))))))).).))))))--.)))))).))))-....((--((.-.....)))).-- ( -30.80)
>DroVir_CAF1 4465 104 - 1
------UGCGCAUUUUGGGCGUGUGAUUUGUGGCAAAGUGAUGAGC-UUGGAUUCCAUCCCCUUGUUGCAAACCUCACGCC--AAAGGUGGCGC----AUUU--AAC-CAGCAAUAUAAA
------((((((((((.((((((.(.((((..((((.(.((((...-........)))).).))))..)))).).))))))--.))))).))))----)...--...-............ ( -36.80)
>DroPse_CAF1 3154 113 - 1
AGACUGUGGACAUUUUGGGUGUGUGAUUUGUGGCAAAGUGAUAUGCAUUUGAU--CAUCCCCUUGUUGCAAACCUCACGCC--AAAGUUGAAUCCCACACCU--ACA-CUCUCAUAUAAU
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>DroGri_CAF1 5406 103 - 1
------UGUGCAUUUUGGGCGUGUGAUUUGUGGCAAAGUGAUGAGC-UU-GAUUCCAUCCCCUUGUUGCAAACCUCACGCC--GAAGGUGGCGC----AUCU--AAG-CAACAAUAUUAA
------((((((((((.((((((.(.((((..((((.(.((((...-..-.....)))).).))))..)))).).))))))--.))))).))))----)...--...-............ ( -37.10)
>DroWil_CAF1 4409 100 - 1
------UGGGCAUUUCGGGCGUGUGAUUUGUAGCAAAGUGAUAUGUACUUGAU--AAUCCCCUUGUUGCAAACCUCACGCCGGAAAGAUGUC-U--CCAAAU--ACAUCAGUC-------
------..(((.((((.((((((.(.((((((((((.(.(((.(((.....))--)))).).)))))))))).).)))))).))))(((((.-.--......--))))).)))------- ( -34.10)
>DroAna_CAF1 4457 102 - 1
------UGGACAUUUUGGGUGUGUGAUUUGUGGCAAAGUGAUAGGUAUUUGAU--CAUCCCCUUGUUGCAAACCUCACGCC--CAAGGUGCUUUC-CAACGGCAACA-UAUCA----G--
------(((((((((((((((((.(.((((..((((.(.(((.(((.....))--)))).).))))..)))).).))))))--)))))))...))-))..(....).-.....----.-- ( -38.70)
>consensus
______UGGGCAUUUUGGGCGUGUGAUUUGUGGCAAAGUGAUAUGCAUUUGAU__CAUCCCCUUGUUGCAAACCUCACGCC__AAAGGUGACGC__C_AAAU__ACA_CAGCAAUAUA__
.......(((((((((.((((((.(.((((((((((.(.(((..............))).).)))))))))).).))))))...)))))).))).......................... (-24.89 = -23.97 +  -0.92) 

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