Locus 1634

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>2R_DroMel_CAF1 6163361 93 + 20766785
---------UACCUUUUAACUU-------AAAUUUAUUUAGCUCUUCCCAAAGGAGCUUCCGUGCCUUCUUUGGGAUUAUCCAACAAGGCUGUCUACAAGGUAGAUUCU-
---------((((((.((((..-------..........(((((((.....))))))).....(((((..((((......)))).))))).)).)).))))))......- ( -22.00)
>DroSec_CAF1 1607 93 + 1
---------CACCUUUUAACUU-------AAAUUUAUUUAGCUCUUCCCAAAGGAGCUCUCGUGCCUUCUUUGGGAUUAUCCAACAAGGCUGUCUACAAGGUAGAAUCU-
---------.............-------.........((((.((((((((((((((......).)))))))))))..........))))))(((((...)))))....- ( -21.40)
>DroSim_CAF1 1606 93 + 1
---------UACCCUUUAACUU-------AAAUUUAUUUAGCUCUUCCAAAAGGAGCUCUCGUGCCUUCUUUGGGAUUAUCCAACAAGGCUGUCUACAAGGUAGAAUCU-
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>DroEre_CAF1 1608 97 + 1
---------UAGCUUUUAACUU---AUUAAACUUUAUUUAGCUCUUCCCAAAGGAGCUUCCGUGCCUUCUUUGGGAUUAUCCAACAAGGCUAUCUACAAGGUGGAAUCU-
---------(((((((......---.(((((.....)))))....((((((((((((......).))))))))))).........)))))))(((((...)))))....- ( -23.30)
>DroYak_CAF1 1610 106 + 1
UAGUUUACUUACCUUUUAAUUU---AUUUAACUUUAUAUAGCUCUUCCCAAAGGAGCUUCCGUGCCUUCUUUGGGAUUAUCCAACAAGGCUAUCUACAAAGUCGAAUCA-
......................---(((..(((((..(((((.((((((((((((((......).)))))))))))..........)))))))....)))))..)))..- ( -23.70)
>DroAna_CAF1 1598 101 + 1
---------UUCCUUUUUAUAUAAAAUUUGUCUUGUUUUAGCUCUUCCGAAAGGCGCUUCUGUGCCUUCCCUCGGACUGUCGAACAAAGCCGUUUACAAAGAGGAAUCAC
---------(((((((((...((((....(..((((((..((...((((((((((((....)))))))...)))))..)).))))))..)..)))).))))))))).... ( -30.00)
>consensus
_________UACCUUUUAACUU_______AAAUUUAUUUAGCUCUUCCCAAAGGAGCUUCCGUGCCUUCUUUGGGAUUAUCCAACAAGGCUGUCUACAAGGUAGAAUCU_
......................................(((((..((((((((((((......).)))))))))))...........)))))(((((...)))))..... (-16.66 = -16.94 +   0.28) 

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Window 6

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>2R_DroMel_CAF1 6163361 93 - 20766785
-AGAAUCUACCUUGUAGACAGCCUUGUUGGAUAAUCCCAAAGAAGGCACGGAAGCUCCUUUGGGAAGAGCUAAAUAAAUUU-------AAGUUAAAAGGUA---------
-......((((((...(((.(((((.((((......))))..))))).....(((((.........)))))..........-------..)))..))))))--------- ( -24.40)
>DroSec_CAF1 1607 93 - 1
-AGAUUCUACCUUGUAGACAGCCUUGUUGGAUAAUCCCAAAGAAGGCACGAGAGCUCCUUUGGGAAGAGCUAAAUAAAUUU-------AAGUUAAAAGGUG---------
-......((((((...(((.(((((.((((......))))..))))).....(((((.........)))))..........-------..)))..))))))--------- ( -24.20)
>DroSim_CAF1 1606 93 - 1
-AGAUUCUACCUUGUAGACAGCCUUGUUGGAUAAUCCCAAAGAAGGCACGAGAGCUCCUUUUGGAAGAGCUAAAUAAAUUU-------AAGUUAAAGGGUA---------
-......((((((...(((.(((((.((((......))))..))))).....(((((.........)))))..........-------..)))..))))))--------- ( -24.20)
>DroEre_CAF1 1608 97 - 1
-AGAUUCCACCUUGUAGAUAGCCUUGUUGGAUAAUCCCAAAGAAGGCACGGAAGCUCCUUUGGGAAGAGCUAAAUAAAGUUUAAU---AAGUUAAAAGCUA---------
-.................((((((((((......((((((((..(((......))).)))))))).(((((......))))))))---)))......))))--------- ( -20.50)
>DroYak_CAF1 1610 106 - 1
-UGAUUCGACUUUGUAGAUAGCCUUGUUGGAUAAUCCCAAAGAAGGCACGGAAGCUCCUUUGGGAAGAGCUAUAUAAAGUUAAAU---AAAUUAAAAGGUAAGUAAACUA
-..(((..((((((((....(((((.((((......))))..))))).....(((((.........))))).))))))))..)))---...................... ( -25.70)
>DroAna_CAF1 1598 101 - 1
GUGAUUCCUCUUUGUAAACGGCUUUGUUCGACAGUCCGAGGGAAGGCACAGAAGCGCCUUUCGGAAGAGCUAAAACAAGACAAAUUUUAUAUAAAAAGGAA---------
....(((((.((((((...((((((.((((......))))(((((((.(....).)))))))...)))))).....((((....)))).)))))).)))))--------- ( -24.50)
>consensus
_AGAUUCUACCUUGUAGACAGCCUUGUUGGAUAAUCCCAAAGAAGGCACGGAAGCUCCUUUGGGAAGAGCUAAAUAAAGUU_______AAGUUAAAAGGUA_________
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