Locus 7045

Sequence ID 2L_DroMel_CAF1
Location 19,696,763 – 19,696,864
Length 101
Max. P 0.824782
window11238

overview

Window 8

Location 19,696,763 – 19,696,864
Length 101
Sequences 6
Columns 101
Reading direction forward
Mean pairwise identity 82.38
Mean single sequence MFE -29.53
Consensus MFE -20.26
Energy contribution -19.88
Covariance contribution -0.38
Combinations/Pair 1.39
Mean z-score -2.50
Structure conservation index 0.69
SVM decision value 0.69
SVM RNA-class probability 0.824782
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2L_DroMel_CAF1 19696763 101 + 22407834
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>DroSec_CAF1 118521 101 + 1
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>DroSim_CAF1 97768 101 + 1
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>DroEre_CAF1 94669 101 + 1
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>DroYak_CAF1 93436 101 + 1
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>DroAna_CAF1 94818 101 + 1
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>consensus
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