Locus 6127

Sequence ID 2L_DroMel_CAF1
Location 17,125,080 – 17,125,200
Length 120
Max. P 0.913720
window9777

overview

Window 7

Location 17,125,080 – 17,125,200
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 94.00
Mean single sequence MFE -38.76
Consensus MFE -33.94
Energy contribution -33.86
Covariance contribution -0.08
Combinations/Pair 1.12
Mean z-score -1.53
Structure conservation index 0.88
SVM decision value 1.09
SVM RNA-class probability 0.913720
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2L_DroMel_CAF1 17125080 120 - 22407834
GACAACGCUACGAGAGGGUUAAGGGGCUAGAAGGAGUAUUUAGCUCUCCUCUCUGUGUGCUUAGCUAAUGGUUCAGUCUAGCUUAGGUAGCCCUAAAGGAGAUUCCAUUCCCAGUCAGAA
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>DroSec_CAF1 88860 120 - 1
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>DroSim_CAF1 104946 120 - 1
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>DroEre_CAF1 91101 120 - 1
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>DroYak_CAF1 91857 119 - 1
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>consensus
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