Locus 3597

Sequence ID 2L_DroMel_CAF1
Location 10,477,419 – 10,477,539
Length 120
Max. P 0.522105
window5682

overview

Window 2

Location 10,477,419 – 10,477,539
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 89.67
Mean single sequence MFE -45.40
Consensus MFE -36.38
Energy contribution -37.70
Covariance contribution 1.32
Combinations/Pair 1.18
Mean z-score -1.37
Structure conservation index 0.80
SVM decision value -0.02
SVM RNA-class probability 0.522105
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2L_DroMel_CAF1 10477419 120 - 22407834
CGCAUUCGGGGGAAUCUUCCCGAUCAUGGAGAUUGCCAUCCGAAGUGGGAUUUGUGUAUAGCAUAUGGCGGUGCAGGAAUAUGUUUUCCACGUCCACGGAUGAGGCAUCUCCAUGCUGGG
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>DroSec_CAF1 5808 120 - 1
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>DroSim_CAF1 5534 120 - 1
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>DroEre_CAF1 8601 120 - 1
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>DroYak_CAF1 6225 120 - 1
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>consensus
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